EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23943 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:1505766-1507506 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr3:1506451-1506465TTTGTTTACGATGG-6.19
IRF1MA0050.2chr3:1507423-1507444AATGCGAAAGTGAAAGCATGC-6.85
IRF2MA0051.1chr3:1507427-1507445CGAAAGTGAAAGCATGCT+6.44
SOX10MA0442.2chr3:1506886-1506897AAAACAAAGCA+6.02
SP1MA0079.4chr3:1506525-1506540TAAGCCACGCCCAAA+6.1
Enhancer Sequence
TTCGAGTCCA GCTTTTGCAG AGCTCACTTC TCCTGTTAGT AAACATGAAT CTTAATAAAA 60
CAAGGGATTA GTAAAGATAT TTCTGATTAT AGTTTGAATT AATATGATCG TTTATGCATG 120
CACACCAGAG GTGTGGACTC GAGTCATGTG ACTTGGACTC GAGTCAGACT CGAGTCATGA 180
ATTTGATGAC TTTAGACTCG ACTTGACAAA ATATAAAAAG ACTTGCAACT CGACTTGGAC 240
TTGAACATAA ATGACTTGGA CTTTGACTAG GACTTGCCCC TATTGACTTG TAAAGACTTG 300
CTGCTTCCCA TGAAAAGCCC AACGATAAAA AAGTATGTTG ACATGGACCG CTCTCTCTCT 360
CTCCCCGTTT ATGTGTGCGT GTGTGACAGC ATGCGCGCGC GTGTGTGAGC ATGCGCGCTT 420
TCGGCATGAC GTCCAATCGA AGCACGGTAG ATTGTTTTGA TTCGACACTA TCCAACGTGA 480
CTACTATGAG GCGCCGGAGT GGACAAAAGT CAAGCGAACG CAGAGAGAAT TTGAATTTGA 540
ACTTGAGATC GAGCCAATAC TCGCGTGCCA ATACTCGCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC 600
TCTCTCTCAC ATACAACATA CACCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCGTGCAT 660
TCAGTCTCTT TGCGTTCGCT TGACTTTTGT TTACGATGGC GTCTCATACC TTTAGTGCTT 720
TTGCTCTCAC GGGATCCTCC TTTTAAACTG ACCCTTCGCT AAGCCACGCC CAAAAACCGC 780
CACCCACCAA TCGCGGCTTA CCAATCGTAG CTACGGGCAG AGGCTCTGTC AAGCTTTCGA 840
GCGAGGGAAA CAAGCCAAAT CGTTGCGCAA TTGGATTGTG AAAATCTGAC ACCCGCTATC 900
CTAAAAGTTT GGACTGGGTG GTGGGATTTT TTCCCTTTTC AAAAGCAAAG CCCAAGAGGA 960
GAAATGCCAG CGTGGATCAA GCTGTGTGAG GGGCGGTAAA GGAGTTAAGC TAAGTTGGTT 1020
TTGTTTTCGA TATTCACATT CAATGATAGG TGGTAATAAC TCACACTCCT CTTATCCTAA 1080
ACAGATCTAA ACTGTGTTTC TTTTAAAAAA ATAAATAAAA AAAACAAAGC AGGTTATGCT 1140
TCCCAGCGGT CTTTTTCTTT TTTTCCACTC GATATTATGA GCCAGGGCTC GACAATAAGG 1200
ACTGCCCGAT GGCCCGGGGC CAGCGTGCGA GACACTCGGG CCAGTGTACA AAATGTTACT 1260
GGCTCGATCG GGCCAGCTGC TGCCTTTTTG CCTGCCAGAT CGAGCCAGAG CTGCGCGCTG 1320
CGACTGTCTG TCAATTGTGT GCAAATACAA TCTTACGGTG CTTTCACACA TAGACGTTTG 1380
TTTCGGAATC TGTCTCGTTT CACCCGTTAG CGCGTTTTTT TTTGGCATAT ATCCAGCAGT 1440
TGCGCTCGCT TCCGCGCCAA ATCAATCAGT CCAAGATCGC CTGAATGAGA CGCGGTCTCT 1500
GTCCTATTGA GCAGATCGAT TGTAGCGAGA AAACAAAACA ATGCAACGAA CTAACGACCC 1560
AGGCTATATC ACAGTGTATC ATGATCGTGT AATAGCCATA TATACGGCTA TATGAAGAGA 1620
GAATGATGAG CAGGGCGAGA TGTCATTCTT ACCGGTAAAT GCGAAAGTGA AAGCATGCTG 1680
AAATATTACC GAGAGCTGTT TGTCCAGCCT GATCTCGGTT TATCCGTCAG GAAAATTGAC 1740