EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23934 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:1419995-1421776 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr3:1421628-1421638GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr3:1421628-1421638GTCACGTGAC-6.02
PBX2MA1113.1chr3:1421049-1421061CTGATTGACAGG+6.62
PBX3MA1114.1chr3:1421047-1421064CGCTGATTGACAGGTGA+6.07
USF1MA0093.2chr3:1421627-1421638GGTCACGTGAC-6.14
Enhancer Sequence
CGTTATAGTT ATCGTCCGCT GGTGTAGAGG CTAATATAGT TATCGTTATA GTTCTCGTCT 60
GCTGGTGTAG AGGCTAATAT AGTTATCGTT CGCTGGTGTA GAGGCTAATA TAGTTATAGT 120
TATCGTCTGC TGGTGTAAGG GTTAATATAG TTATCGTTAT AGTCATCGTC CGCTGGTGTA 180
GAGGCTAATA TAGTTATCGT TATAGTTAAC GCCCGCTGGT GTAGAGGCTA ATATAGTTAT 240
CGTTATAGTT ATCGTCCGCT GGTGTAGAGG CTAATATAGT TATCGTTATA GTTATCGTCC 300
ACTGGTGTAG AGGCTAATAT AGTTATCGTT ATAGTTATCG TCCGCTGGTG TAGAGGCTAA 360
TATAGTTATC GTTATAGTTA TCGTTCGCTG GTGTAGAGGC TAATATAGTT ATCGTTATAG 420
TTATCGTTCG CTGGTGTAGA GGCTAATATA GTTATCGTCC GCTGGTGTAG AGGCTAATAT 480
AGTTATCGTT ATAGTTATCG TCCGCTGGTG TAGAGGCTAA TATAGTTATC GTTATAGTTC 540
TTGTCCGCTG GTGTGGAGGC TAATATAATT ATCGTCCACT GGTCCGCTAA AATTATTTAA 600
GCACCATCAA GATGATTAAA TAAATATGAT ATATTATTGA TTCTTAACTG AGAACCCTGA 660
TATTTTTCCA CACAAACAAC ACTGGAGATT TTACCAGCAT TTACAGACTA AATGTAATAT 720
CCTGCTTAAA TCACACTTTT CTCTTCAATG TGATATTAGC TCAAATTCGT CTGAAATAAA 780
TTATGTTTTG ATTATTCAGT AAAGGAGACT GATCATCGAA GAACTGATTC AGTCCGAAAT 840
GATCGTTGAT TTTTAAATTA GGCGCGAAGA GAAGCGCGGG AAAGAAAAAT ACACCAACAG 900
ATCTGATCTG TACACTTTCA CCATCTATAC CTCTCATTTT CAGCATTATT ATGGGTTATT 960
AGTGTGAGCC TGTCGTTAGT CTGATCTACA CGACATCAAT AATAAACATC ATATGGTAGA 1020
CCGTGACACA CACACACACA CACAGGCACG AACGCTGATT GACAGGTGAA GTGTGTTCAC 1080
TGACACCCCC CCACACACAC ACAGCTGTCA GATTATCCGC ATTTCCACAT TCATTCGCTC 1140
TATATTCATC TATTTTATTT AATAATCACT GATTCTATAA TCAATACATG TTTGTAATTC 1200
TGTATGACCT GATCAGTGTG TGTGTGTGTG GCTGATCGTG TTACTCACGC ACTTTCTTCG 1260
GTTTGGCCAG AATGGCGCCG GTGGCTGTGT TCACTGCGGT CCGGTGTTGC AGCTGCTGAA 1320
GCCCGAGCTG AGGAGAACAC ACCGACCGGC ACACGAACCG ACGGACAACC GACACCGCCG 1380
CCATGACCGA CGGAGAGAGC GATATAGAGG TGTGTGTGTG ACAGAGAGAC AGAGAGCGAG 1440
GTGTGTGTGC GCGCGGAGAG AGAGAGAGAG CTCCACACAC TGACAGATGA TACCGGCGCG 1500
TGTGTGAGAG AGAAAGTGTG ACTGAATGTA CACTACTATA AACAGTGTTG TATTTTACTG 1560
TATATTCTCC CGACTGTAGA GTTCATATCT CAGAATAATC AGAACACGAC ATGTTGGGTG 1620
ATGTAGGTTA ACGGTCACGT GACAGAAAGC GCGCATTTCC TCTTTAATTG AGGTTTATTT 1680
TGCTGGCTGT GCTCTCAAAA TGGCTTTATT AATGTTTCAT TTTCATTTAG TAGTAAATCA 1740
CTCACTGTAG TCATGATCGC GACCGCTTCT GCTCTTTATA G 1781