EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23914 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr3:662323-663327 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr3:662566-662580TGATGACGTCAGCT-6.31
BATF3MA0835.1chr3:662566-662580TGATGACGTCAGCT+6.57
ELK3MA0759.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
ETS2MA1484.1chr3:662871-662881ACTTCCGGTC-6.02
ETV1MA0761.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
ETV4MA0764.1chr3:662870-662880TACTTCCGGT-6.02
FOXB1MA0845.1chr3:662399-662410AATGTAAATAT+6.32
Lhx3MA0135.1chr3:662919-662932GATTAATTAATGT-6.03
POU1F1MA0784.1chr3:662963-662977AATATGCTAATGAT+6.58
POU3F2MA0787.1chr3:662964-662976ATATGCTAATGA+6.27
POU3F3MA0788.1chr3:662963-662976AATATGCTAATGA+6.11
POU4F1MA0790.1chr3:662917-662931ATGATTAATTAATG+6.04
POU6F1MA0628.1chr3:662920-662930ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:662920-662930ATTAATTAAT-6.02
YY1MA0095.2chr3:662338-662350CAAAATGGCGGC+6.92
Enhancer Sequence
AGCGCTACCC TGTACCAAAA TGGCGGCTCT ATTGACGCAT TCCTTCCTAT AGACAACAAC 60
AGGGTAGGCG ACATCTAATG TAAATATCTA TGGTAGTGCA CAAACAGCAT TCAAATTCAA 120
GTAAATGTAT TATTTACTTG ATTTTCTTTC ATATAAAGCT AAATCTTTCG AGCGTTTAAT 180
TCCTCTCGTT AATATTAAAT CTATTTCAAA AAGCCTAAAA CTAGCGCGGT GTTTATGACG 240
CGCTGATGAC GTCAGCTCGC GTGCGTCCTC CCCTCAAATC GCTCCGTGCG GAAACTGGCG 300
GCGCGCGCGT GGCACGAGCG ACCGGAGGAA CAGACACAGA TCAGACGCGC CGCTGCGCTC 360
CGGTGTGTTG AATGAATAAA TAAACCCTCG ACGCGTTTAC CGATGACCGC GAGCACTGCA 420
CGGTGAAGGT GAGCAACCGA GGATTTAGAT CCGCATCACA CACATACACA CACACACACC 480
GCTGCAACAT CTGCACTGCT CGAGATTATA CTGATCATCA TAATAATCCG GTGTCGTGAG 540
TGAGGGGTAC TTCCGGTCAC CGATAATCTC AGAGCAGTGC TAGCGTTAGT AATGATGATT 600
AATTAATGTA CTATAGTAGA GCACACAGCT GCTGGTGATA AATATGCTAA TGATGTGGTT 660
TCCTGATGCC TGCATCATCT CTCCGGAACC CTTCTGCTCT GGATATTAGT ATGCTGATGT 720
GTGGAGGACC CGAGCTCTGA CCTGGTTTAT CAGCACACCT GCGCTACAGT CCCGCTGTCT 780
GACTGCTTTA ACAGTGGATA TACAGTGACT TCAGTGAACT GTAGAGCAGT CTGTGTGTGT 840
TGATGTGGGT CTGGGACTGC GCTGGAGATG TTCTGCTGTG GTTTACTGGC ACTGGTTTTC 900
CTATTGGTCA AGAATTCAGC TGGTTTTATC CCTGTATAGA GATGTTGACC TGTGGATTGA 960
TCTGGGTTTA GGTGGTTTTC ACTTCTATAT CAACATAATA ATGC 1004