EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23688 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:31951272-31952568 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr25:31952363-31952374TCTGATTGGTT-6.62
NFYBMA0502.1chr25:31952364-31952379CTGATTGGTTGAGGG-6.2
PKNOX1MA0782.1chr25:31951454-31951466TGACAGATGTCA-6.52
PKNOX1MA0782.1chr25:31951454-31951466TGACAGATGTCA+6.74
PKNOX2MA0783.1chr25:31951454-31951466TGACAGATGTCA-6.52
PKNOX2MA0783.1chr25:31951454-31951466TGACAGATGTCA+6.62
TGIF1MA0796.1chr25:31951454-31951466TGACAGATGTCA+6.62
TGIF1MA0796.1chr25:31951454-31951466TGACAGATGTCA-6.74
TGIF2MA0797.1chr25:31951454-31951466TGACAGATGTCA+6.62
TGIF2MA0797.1chr25:31951454-31951466TGACAGATGTCA-6.74
Enhancer Sequence
ACTACATTTT TAGGCAGGTA ATGCTACTTT TCTTACGCAC GATTTTTCAG TACTCTTTAC 60
ACCCCTGCCC TGCACTAATA TGCAACATTT ACACTTTGAT TTACCCTGAC AAAGCAAATA 120
TGAACTGTAT ATGAACTGTG TCCACTTATG AAGTGTAGCA GATGTGGTTT CACTACAGAT 180
GATGACAGAT GTCAGTGTGA TGTTTGTGAA ACATGTGTTC AGTAAGTGGC CTCGATACCT 240
CTTGTTCTCT GGCATAATCC TCCTGATCGT ACTCCTCTTC CTCTTGCTGG GTCTGTAAAG 300
CAGCGCTGTC GAAATCAATA GACATCCTGC AGACTTGAGA GAAGAAATGA CACACTGAGA 360
CAGGAAATGA CCGACAATCG CATCCGTTTA AACCTCATTT AACCAGACTC GCTGATAAAC 420
ACAAAGCAAC TGCAGTGTAA ACATTAGACG GCATTATAAA ACATTGCTAA GCAATATCGT 480
TTCTCGGTAA CCGGTTGTTA GAAGGGATAC ATCTGTGGCC GGAAGTTAAC GATAATTATT 540
TATATTATTT ATAAACTTAA CTATTACTTG TATTTTATTA ACGTCAACCC CAACCCTCAA 600
CCTAATGTGA AAATTATTAG ACTTGTAATG TTAGTGTTTA AAAAATTATG CTAAAGTTAA 660
CGTTATATTG ATACGAGTAT CCTCACCTGT ATCCCATCTA GAGTTGACTT CACTTTAAGC 720
AGCATAACAC ATTACTCGCA CTTTTGAAGC AGTAAAACTA AACAATGTAC CACTAGTTTA 780
TAAGCTAGTT AACTCAAACA AGACTAGTAA CGTTATTATG TTGTCTGCTT ACCTTTTAGT 840
CAGTTATAAA GTCACCTGGG TTTTATATTA ACACAGTAAC GTAATCCAAC ATGAAGAGTT 900
TGTATAAGGA ACATTACAGT GCCTCTCCAG CTCAACAAGC GACAATACTA ACATGAAATA 960
ACGATAAATA AAGCGTCCGC GGATGTTTGT TGAGTAGGAA AGTAGTTTTA AAAGCGATGT 1020
TGCAGGAAAT GTGTTGATAA CAGAGGGACC ATTGAAACAT GGCGCTCTAA ACAGCGGCAA 1080
AACTCCAGGG TTCTGATTGG TTGAGGGGAG GGAGGACGTC ATGTCAACGT TACAGCCAAT 1140
GGTTACCTCA GATCACGTGT CAACCAAAAC AATACGCCCT CTCGGCAGGA ACTGAAATCG 1200
TTTTTCAACA ATATAATCAT ATTAATAACC ATAACATCGG ATGACATCAA GTACAATAAT 1260
AAACAAGGAA ATAAAGACGT TTAAATACAA AGAAAA 1296