EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23606 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:27429778-27431024 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF3MA1418.1chr25:27430637-27430658CAGAAAAGGAATGTGAAACTG+6.43
RFX5MA0510.2chr25:27430478-27430494GGTTACCATAGCAGCG-6.19
ZNF24MA1124.1chr25:27430186-27430199AAATGAATGAATG-7.34
Enhancer Sequence
TTTAAGCGTC AGCTGGGTCA GTTGGCATTT CTGTGTGGAG TTTGCATGTT TTCCCCATGT 60
TCGCATGGCC ACGTGTGTTT CCTCCGGGTG CTCCGGTGTC CCCCACAGTC CAAAGACATG 120
CACTATAAGG GAATCGGGTA AGCTAAATTG GCTGTAGTGT ATGTGTGTGA ATGAGGGTGT 180
ATGGGTGTTT TCCAGTGATG GGTTGCAGCT AGAAGGGCAT CCGCTGCATA AAACCCAAGT 240
TGGCGGTTCA TTCCGCTGTG GCGACCCCTG ATGAATAAAG GGACTAAGCT AAAAAGAAAA 300
TGATTGATGA TAACTTGCAC AAAATGGTGA CTAAAAATAA CAGTAATTTA TTTAAATGAG 360
GGCGGTTCAT TCCGACGTCG GATAAATAAA AGGACTAAGC CGACAAGAAA ATGAATGAAT 420
GACTATTTGA GTAACTCAAC TGTTTGACTT AATGCTTAAA TTCATTCTGT CATCAGAACT 480
AGGCTATATT TAGTTTAGTT TTTCAAGGGC ATCAGTCGAA GTTAAATTTC TTCGAGTTAA 540
ATTACTTCCC GTCTTACTCT TATAATCCTA AACAAAGTGG TTCAGCTAGC ATTCAATTAC 600
AAACGCTTTG CGAGTCGGTT AGACTGAATC ACCAAAAAAG AATCGGCTCA AGCGAATGAC 660
TCATTTGTGA ATGGACACTC CTAGCGACTG GCGACACTGT GGTTACCATA GCAGCGCCGA 720
AATACAGTGA AGCCAGCGTA AACATAAGAT CCACTATTTT ATTTAAAACA ATAATAAAGA 780
TTTCGCCGTC AGATAGCTTT CACAATAAAG AGAGGCAATC GTGTTTTTGC GTATTTTGAG 840
CATTGAGTGA CTGCAATGTC AGAAAAGGAA TGTGAAACTG TGAACCTTGA AGAGCAAAAA 900
ATGTCATCAG AAGCCATTCA AATAGAGACT GAGGAGGCTG ATGAAGATCA AGATGTTGAA 960
CACACGCAAG AGATCAGTGT GGACGTCATT ACAAATCCGG ACACACTTTT ACTAGAAGAA 1020
AACAGCGCTG AACCAACTTC TGAAGACCAA AGACAACAAG ACGATATAAA CAAACAAGGA 1080
AGTGAAAATA AGATCATTTC TTCCAATGAT GTTGGAAACT CAACAGCAAC GGGTAAATAC 1140
TAGAATCCAT AGTATTGGTA TCTAGGTATG ACAGTTTTGT AATATAGAAA TTTAAAAGAG 1200
AAATATAGGG ATTTTGTAAT GCAAACTAAA TAATTTAAAT GTTTAT 1246