EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23466 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:25199486-25201871 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr25:25200249-25200262GTTTTCACACCTC-6.78
IKZF1MA1508.1chr25:25201268-25201280CAAACAGGAAGT+6.02
IRF1MA0050.2chr25:25200979-25201000AGAGAGAAAATGAAAACGAAA-6.16
IRF1MA0050.2chr25:25200985-25201006AAAATGAAAACGAAACTTAAT-7.17
IRF3MA1418.1chr25:25200982-25201003GAGAAAATGAAAACGAAACTT+6.98
IRF9MA0653.1chr25:25200987-25201002AATGAAAACGAAACT+6.41
KLF13MA0657.1chr25:25200279-25200297GAAAAGTGGGCGTGTCCA-6.67
KLF14MA0740.1chr25:25200282-25200296AAGTGGGCGTGTCC-7.06
SP4MA0685.1chr25:25200281-25200298AAAGTGGGCGTGTCCAG-6.7
SP8MA0747.1chr25:25200283-25200295AGTGGGCGTGTC-6.37
STAT1MA0137.3chr25:25200616-25200627TTTCCCGGAAA-6.32
Stat4MA0518.1chr25:25200613-25200627GCATTTCCCGGAAA-6.25
TBR1MA0802.1chr25:25200251-25200261TTTCACACCT-6.02
TBX2MA0688.1chr25:25200251-25200262TTTCACACCTC-6.14
Enhancer Sequence
TTAACTTTTT AGAGTGTACA CCGCGATTAT AGGGCCCAAT ATTGCTAGGT CGAAGGGGGG 60
CATTATTATT CTAAACAAAT ATCAGAACAT TTTGTTTAAT CATTTAACCA AATGGCGATG 120
ATTCCACCTT TTCTGATCAC TAGCGACATG TTGCTCTGTA TTTATCATGG GAAACATTAC 180
CGTTTTACAA GTTATGAAGA AAACATCTGC CATAACGTTA ACTTGCTGTC GATTGTAACT 240
TATTATTTAA CAGAAATACA CACAGTATAA TAAACTAATA ATAAACTAAT AATTAAGTAG 300
TGTTACATCT GGCTTACCTG ATTCAAAGAT GACGATTATA ATAAAAGCGT CGTGTGATTG 360
GTCAAAAGTA AGCCATCGAG GAGAAACGCG ATTGGTCAAA CATACGTCAC AGCAAAAAGA 420
AATGCGATTG GTCAAAAGTA AGCCACTGAA GTGAAACGCG ATTGGTCGAA ATGACGTCAG 480
CGCAAAGACA AACGTGATTG GTCAAAAGTA AGCCACAGGG GTTAAACTCT ATTGGTCAAA 540
AGTAAGCCAC CGAGGTGAGA CGTGATTGGC TCATGTGGGC TTACTTTGGG CTTACTTTGG 600
CTCTGTAGAC GGGATGCTGC AGGCGCAAGC GAGAGGTAGC GGGATCGATG CCCGCATTCT 660
CCACATGAAT CTCCGCATCT GTTTTCATGC CTTTCACACT GGCTTTCATT GCATACCTGG 720
TTGCACCTTA AAGGGCCATG AAACCCCCTC GTTTCAGCAG GGTGTTTTCA CACCTCTACT 780
TTGGAAAAAG TCAGAAAAGT GGGCGTGTCC AGCTCTGTTT AGGGGGGAGT GTCGGAGGAA 840
CTAAAGTGGG ATGGTGTGGG AGTGTCTATT TGGGCACGCG CGAGTTTCAG TCAAAATACA 900
CACACATGAG AAAGTGATGG TGTTTAACCT ACATGGACAT CTGTAGTCGA ATTATTTGCC 960
AAATTATTAA ATGTTGGACT TTAACAGCAG TTTGGCTCTT TCATTCAGGG AATTAATTCA 1020
TGCCCCTCGC GACAAACGCG ATATTTGATT CGAGGATCTG CTCTAAGCGT CTATTTTTTC 1080
ATGCAATGTT TGATACCGCA CGGCGAATGA GAGAAAAAAA AAACTCTGCA TTTCCCGGAA 1140
ACTTAGATGC TCTCGGCAGG TAGCGTCAGA AAGCCGCGTG TGTTATTCCG GTCACAAAAT 1200
GCCGTGCTAT GTTTGCACTC AGTGCAATAG TTAACTTAAT TCGATACCAA CAAACTGAAT 1260
AAACAAAGAG CACTGGTCGC TCACTTACCA AATCTGTAGA GACAGGACAA TCACCAGCAA 1320
CTAGAGCCGC GTCTTTATGA AGAGGAGACT AACGTTACAA GCGAATCCGG ATTTCAGCGT 1380
TTGCAGATGA GAACAGCTCT CAGGTAAACA ATGTTCCTCC TTAGACACGT AAGTTATTGT 1440
TGTCGAGCGT CGCGTACACT GTTAATCCAC ACGTGAACCA GCTGAGCTCT CACAGAGAGA 1500
AAATGAAAAC GAAACTTAAT GGCAGCAAAC TATAAAACAA CACTTCACGC TTGTTTTGCC 1560
AACACAACGT GGCGTCTCTG TGGCGTTAAC ACGGTGACGC TAATGAATAT TAATGAAGTT 1620
GCACAATAGA GCGCGCTGAT TGGTTTGACC CAAGCCTTAC TCATGCATTA ATGCATCACA 1680
CTGTAAGACG TAATAAGACT CACTCTGGCA CAGACGTCCA GTCTGCACGC TGGAATACAC 1740
GCTATTATGT CATGACCGTG ACGCAGCTTC AAAAATTCGT TTCAAACAGG AAGTACGAAT 1800
TTGCTTGAAA TAACGCAATA ACAACCAATT TACACTTTTT AGTGAAATAT AGGTGTCCTA 1860
ATAGTGTTTT TAGCAGTGTG GGACACATAT ACGACTGTCA ACAGCTCAAA AAATGTGTTT 1920
TGGTGTTTCG TGACCCTTTA AGACTTTATA GTGAAACTTC TTACGTCAGC TTTGCCGGTT 1980
CCTGTCTAGT GATTATCATT GCAACCCTTC AGAAGCCCTA TCAAGTCACA GTTTTCTTTT 2040
AGTCAATGGC GTGTCCGCAG TGGGACATCA AAGCGCTAAA CATATTGAAG ATTGCTGTCG 2100
ATTAGGCCAT TGGAATCATC ACCAGAAGCG ACGTGACCGT CTGGGAGGAA GATGGCGTTT 2160
TGGTCAAGTG GAAGCAGGTG GACTTAAGTG TGAAGCAGCT AGGCTTTTTG AGTGACTTTC 2220
GGTTCCCTGA CCCTCATGCC AAAAACTGAA CGTCAACGCT GCTTTGCCGA AACCCGGGAT 2280
TGAACCAGGG ACCTTTAGAT CTTCAGTCTA ACGCTCTCCC AACTGAGCTA TTTCGGCTGT 2340
CTTGTCTCAA CTGCTCTGCA GCATGGATGT CGGTGAGACC TAGCA 2385