EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23457 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:25177650-25179412 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr25:25178394-25178407GTTTTCACACCTC-6.78
IRF1MA0050.2chr25:25179124-25179145AGAGAGAAAATGAAAACGAAA-6.16
IRF1MA0050.2chr25:25179130-25179151AAAATGAAAACGAAACTTAAT-7.17
IRF3MA1418.1chr25:25179127-25179148GAGAAAATGAAAACGAAACTT+6.98
IRF9MA0653.1chr25:25179132-25179147AATGAAAACGAAACT+6.41
KLF13MA0657.1chr25:25178424-25178442GAAAAGTGGGCGTGTCCA-6.67
KLF14MA0740.1chr25:25178427-25178441AAGTGGGCGTGTCC-7.06
SP4MA0685.1chr25:25178426-25178443AAAGTGGGCGTGTCCAG-6.7
SP8MA0747.1chr25:25178428-25178440AGTGGGCGTGTC-6.37
STAT1MA0137.3chr25:25178761-25178772TTTCCCGGAAA-6.32
Stat4MA0518.1chr25:25178758-25178772GCATTTCCCGGAAA-6.25
TBR1MA0802.1chr25:25178396-25178406TTTCACACCT-6.02
TBX2MA0688.1chr25:25178396-25178407TTTCACACCTC-6.14
Enhancer Sequence
ACCGCGATTA TAGGGCCCAA TATTGCTAGG TCGAAGGGGG GCATTATTAT TCTAAACAAA 60
TATCAGAACA TTTTGTTTAA TCATTTAACC AAATGGCGAT GATTCCACCT TTTCTGATCA 120
CTAGCGACAT GTTGCTCTGT ATTTATCATG GGAAACATTA CCGTTTTACA AGTTATGAAG 180
AAAACATCTG CCGTAACGTT AACTTTCTGT CGATTGTAAC TTATCATTTA ACAGAAATAC 240
ACACAGTATA ATAAACTAAT AATAAACTGA TAATAAAGTA GCGTTACATC TGGCTTACCT 300
GATTCAAAGA TGACGATTAT AATAAAAGCG TCGTGTGATT GGTCAAAAGT AAGCCATCGA 360
GGAGAAACGC GATTGGTCAA ACATACGTCA CAGCAAAAAG AAATGCGATT GGTCAAAAGT 420
AAGCCACTGA AGTGAAACGC GATTGGTCGA AATGACGTCA GCGCAAAGAC AAACGTGATT 480
GGTCAAAAGT AAGCCACAGG GGTTACACTC TATTGGTCAA AAGTAAGCCA CCAGGGTGAG 540
ACGTGATTGG CTCATGTGGG CTTACTTTGG GCTTACTTTG GCTCTGTAGA CGGGATGCTG 600
CAGGCGCAAG CGAGAGGTAG CGGGATCGAT GCCCGCATTC TCCACATGAA TCTCCGCATC 660
TGTTTTCATG CCTTTCACAC TGGCTTTCAT TGCATACCTG GTTGCACCTT AAAGGGCCAT 720
GAAACCCCCT CGTTTCAGCA GGGTGTTTTC ACACCTCTAC TTTGGAAAAA GTCAGAAAAG 780
TGGGCGTGTC CAGCTCTGTT TAGGGGGGAG TGTCGGAGGA ACTAAAGTGG GATGGTGTGG 840
GAGTGTCTAT TTGGGCACGC GCGAGTTTCA GTCAAAATAC ACACACATGA GAAAGTGATG 900
GTGTTTAACC TACATGGACA TCTGTAGTCG AATTATTTGC CAAATTATTA AATGTTGGAC 960
TTTAACAGCA GTTTGGCTCT TTCATTCAGG GAATTAATTC ATGCCCCTCG CGACAAACGC 1020
GATATTTGAT TCGAGGATCT GCTCTAAGCG TGTATTTTTT CATGCAATGT TTGATACCGC 1080
ACGGCGAATG AGAGAAAAAA AAAACTCTGC ATTTCCCGGA AACTTAGATG CTCTCGGCAG 1140
GTAGCGTCAG AAAGCCGCGT GTGTTATTCC GGTCACAAAA TGCCGTGCTA TGTTTGCACT 1200
CAGTGCAATA GTTAACTTAA TTCGATACCA ACAAACTGAA TAAACAAAGA GCACTGGTCG 1260
CTCACTTACC AAATCTGTAG AGACAGGACA ATCACCAGCA ACTAGAGCCG CGTCTTTATG 1320
AAGAGGAGAC TAACGTTACA AGCGAATCCG GATTTCAGCG TTTGCAGATG AGAACAGCTC 1380
TCAGGTAAAC AATGTTCCTC CTTAGACACG TAAGTTATTG TTGTCGAGCG TCGCGTACAC 1440
TGTTAATCCA CACGTGAACC AGCTGAGCTC TCACAGAGAG AAAATGAAAA CGAAACTTAA 1500
TGGCAGCAAA CTATAAAACA ACACTTCACG CTTGTTTTGC CAACACAACG TGGCGTCTCT 1560
GTGGCGTTAA CACGGTGACG CTAATGAATA TTAATGAAGT TGCACAATAG AGCGCGCTGA 1620
TTGGTTTGAC CCAAGCCTTA CTCATGCATT AATGCATCAC ACTGTAAGAC GTAATAAGAC 1680
TCACTCTGGC ACAGACGTCC AGTCTGCACG CTGGAATACA CGCTATTATG TCATGACCGT 1740
GACGCAGCTT CAAAAATTCG TT 1762