EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23440 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:25141563-25143595 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr25:25141655-25141668GTTTTCACACCTC-6.78
IKZF1MA1508.1chr25:25142674-25142686CAAACAGGAAGT+6.02
IRF1MA0050.2chr25:25142385-25142406AGAGAGAAAATGAAAACGAAA-6.16
IRF1MA0050.2chr25:25142391-25142412AAAATGAAAACGAAACTTAAT-7.17
IRF3MA1418.1chr25:25142388-25142409GAGAAAATGAAAACGAAACTT+6.98
IRF9MA0653.1chr25:25142393-25142408AATGAAAACGAAACT+6.41
KLF13MA0657.1chr25:25141685-25141703GAAAAGTGGGCGTGTCCA-6.67
KLF14MA0740.1chr25:25141688-25141702AAGTGGGCGTGTCC-7.06
SP4MA0685.1chr25:25141687-25141704AAAGTGGGCGTGTCCAG-6.7
SP8MA0747.1chr25:25141689-25141701AGTGGGCGTGTC-6.37
STAT1MA0137.3chr25:25142022-25142033TTTCCCGGAAA-6.32
Stat4MA0518.1chr25:25142019-25142033GCATTTCCCGGAAA-6.25
TBR1MA0802.1chr25:25141657-25141667TTTCACACCT-6.02
TBX2MA0688.1chr25:25141657-25141668TTTCACACCTC-6.14
Enhancer Sequence
TCCGCATCTG TTTTCATGCC TTTCACACTG GCTTTCATTG CATACCTGGT TGCACCTTAA 60
AGGGCCATGA AACCCCCTCG TTTCAGCAGG GTGTTTTCAC ACCTCTACTT TGGAAAAAGT 120
CAGAAAAGTG GGCGTGTCCA GCTCTGTTTA GGGGGGAGTG TCGGAGGAAC TAAAGTGGGA 180
TGGTGTGGGA GTGTCTATTT GGGCACGCGC GAGTTTCAGT CAAAATACAC ACACATGAGA 240
AAGTGATGGT GTTTAACCTA CATGGACATC TGTAGTCGAA TTATTTGCCA AATTATTAAA 300
TGTTGGACTT TAACAGCAGT TTGGCTCTTT CATTCAGGGA ATTAATTCAT GCCCCTCGCG 360
ACAAACGCGA TATTTGATTC GAGGATCTGC TCTAAGCGTC TATTTTTTCA TGCAATGTTT 420
GATACCGCAC GGCGAATGAG AGAAAAAAAA AACTCTGCAT TTCCCGGAAA CTTAGATGCT 480
CTCGGCAGGT AGCGTCAGAA AGCCGCGTGT GTTATTCCGG TCACAAAATG CCGTGCTATG 540
TTTGCACTCA GTGCAATAGT TAACTTAATT CGATACCAAC AAACTGAATA AACAAAGAGC 600
ACTGGTCGCT CACTTACCAA ATCTGTAGAG ACAGGACAAT CACCAGCAAC TAGAGCCGCG 660
TCTTTATGAA GAGGAGACTA ACGTTACAAG CGAATCCGGA TTTCAGCGTT TGCAGATGAG 720
AACAGCTCTC AGGTAAACAA TGTTCCTCCT TAGACACGTA AGTTATTGTT GTCGAGCGTC 780
GCGTACACTG TTAATCCACA CGTGAACCAG CTGAGCTCTC ACAGAGAGAA AATGAAAACG 840
AAACTTAATG GCAGCAAACT ATAAAACAAC ACTTCACGCT TGTTTTGCCA ACACAACGTG 900
GCGTCTCTGT GGCGTTAACA CGGTGACGCT AATGAATATT AATGAAGTTG CACAATAGAG 960
CGCGCTGATT GGTTTGACCC AAGCCTTACT CATGCATTAA TGCATCACAC TGTAAGACGT 1020
AATAAGACTC ACTCTGGCAC AGACGTCCAG TCTGCACGCT GGAATACACG CTATTATGTC 1080
ATGACCGTGA CGCAGCTTCA AAAATTCGTT TCAAACAGGA AGTACGAATT TGCTTGAAAT 1140
AACGCAAAAA CAACCAATTT ACACTTTTTA GTGAAATATA GGTGTCCTAA TAGTGTTTTT 1200
AGCAGTGTGG GACACATATA CGACTGTCAA CAGCTCAAAA AATGTGTTTT GGTGTTTCGT 1260
GACCCTTTAA GACTTTATAG TGAAACTTCT TACGTCAGCT TTGCCGGTTC CTGTCTAGTG 1320
ATTATCATTG CAACCCTTCA GAAGCCCTAT CAAGTCACAG TTTTCTTTTA GTCAATGGCG 1380
TGTCCGCAGT GGGACATCAA AGCGCTAAAC ATATTGAAGA TTGCTGTCGA TTAGGCCATT 1440
GGAATCATCA CCAGAAGCGA CGTGACCGTC TGGGAGGAAG ATGGCGTTTT GGTCAAGTGG 1500
AAGCAGGTGG ACTTAAGTGT GAAGCAGCTA GGCTTTTTGA GTGACTTTCG GTTCCCTGAC 1560
CCTCATGCCA AAAACTGAAC GTCAACGCTG CTTTGCCGAA ACCCGGGATT GAACCAGGGA 1620
CCTTTAGATC TTCAGTCTAA CGCTCTCCCA ACTGAGCTAT TTCGGCTGTC TTGTCTCAAC 1680
TGCTCTGCAG CATGGATGTC GGTGAGACCT AGCAGAGCTC TTGAATGCGT CTGAGGCACA 1740
GGAGGGTAAA AGTTTGGCCA GTACGGGTAT CGAACCCGCG ACCTTGGCGT TATTAGCACC 1800
ACGCTCTAAC CAGCTGAGCT AACCGGCCAC TTTCTGCACA CTAACATAGA AATCCAGGGC 1860
ACTGCCAATG TGGAGTGATT TAGGGATAAC TCGTCATTCG GCATGCAGGA CTCCTCACAC 1920
GTTCCCTGGA GCAGGACCGG GTAGGACCTT TTGAAAAAAG CATGCTATTC CAAGCAATTT 1980
GACGAATACA TATCAAGCAG GGCAAAGGGG CCACCGCAGA GCAGATGTGG TC 2032