EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23436 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:25134628-25135997 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GRHL2MA1105.1chr25:25134942-25134957AGGAACTGGTTTTTC-6.6
MIXL1MA0662.1chr25:25135468-25135478GTTAATTAGA-6.02
Tcf12MA0521.1chr25:25135338-25135349CAGCAGCTGTT-6.32
Enhancer Sequence
CCCTTACCTT AAATAATCCA AGAATTCCCT CAAGGAAGGG GGTGTGAATG TATAACAAAA 60
GGCATTCACA CTTAGTGTCA CACCCCTCAC AGTGGTTCAA AAGATGCCTG AAGTTATATA 120
TTTATTGTTC TGATTATGTC TATTTCTGAG AGAATGAGAC CATTGTACCA ATCGCACTGA 180
GACATTTCAA ATGATATCAA ACATGATAAT TAAAGTCAGT TTGGTTAATC TAAAACATTT 240
AAACATTGAA ATGACCATAT GCGTGAGTTG GGGGGATGAA GCTGAGTCTC AGCATAGTCA 300
GATGCAAATG CAGCAGGAAC TGGTTTTTCC CGCATTCCTC CCTGGTGGGT TGTGAAGTCA 360
CCAGTCTCTG TTTTCAGCTC ATGTTTTGAA TTGTCAAAGA TATCAGAATA TTTACAATAT 420
TTCAATTCTT ACATACCTAC CCGGTTGTCA CATGAGTATC TAAGGAAACA ACATTATAAT 480
CAGGGAAATG CTTTGTTTGC TAAAAATTAA CACAATTAAA ATATTGGCAT TATGAATTAC 540
CTGTATGTCA GCAAAGCTGG GAACTGACTA CGGTGGCCAA TATCCAGCTG TCCTAAGATG 600
TCCTCGGACC AGGCAGGATA CTTTTTTGCA CCGCTTGCAC TCCAGATACT CAGTGGCAAG 660
GTCGTACCAG CCGTCGATGT CGAGGACCTT GCGCACCGTG CGGTAAATTC CAGCAGCTGT 720
TAGTCTGTGC TTACCACAGC TTAGGCGAAC ACAGACAAGT GGAAACAACC ACATCTTCAG 780
CGGCATCCAC AGAAAAAGTG GTCGGCAGAA GAAGAGGTCA GGAGAGGCAG GTGGCTGCGT 840
GTTAATTAGA GGAGGCTGGG GAGGATACCA CCAAAGCTTC AGCTGGGACA CTAGCTCTGG 900
CTTGCCGGTT TTTAAGTTTG TTTTAAATAC CGTGTTCCGG ATCCACTCAT GCTGGAAAGG 960
GGGAAGCTGA TCTTTCCAGT GAACAGGAAG CTCAACTGGT GGCTGATGAT GTTGAAGATC 1020
TGGTGTTTTT GCTGTTTCCG TTGATGGAGA CGGATTGGCA CAGGCCTCTG AGTGAATAGT 1080
AACAAACAAT TTATGGTTAA CAATATTATG ATGACTGTTG CTTTTGATAG TAAGGTGCCA 1140
CAAATTATGC CCATGAACAG CCAGTGAAGC AATAGTTTTG GATAAGTATT ATTATTAATA 1200
TGGGTATACT TAGAAATACA AGTTAAGAGA ATGGTACTGT TAGGAAGCAA AGAAATTAGT 1260
GTGTACTTTA TTGATGAAAG GGATATGGAA TTAACACAAT TCTCTGCGAA TGAGAATCAT 1320
ATGAAATGGA GTAAGTAAAA TGAGGCATGA TTAGTATAAA TTATTGAAG 1369