EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23427 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:25011175-25012161 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr25:25011632-25011642GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr25:25011632-25011642GTCACGTGAC-6.02
LMX1BMA0703.2chr25:25011190-25011201TTAATTAAAAT-6.62
MITFMA0620.2chr25:25011628-25011646GTATGTCACGTGACCTTC+7.31
MITFMA0620.2chr25:25011628-25011646GTATGTCACGTGACCTTC-7.31
STAT3MA0144.2chr25:25011457-25011468CTTCCCAGAAG-6.14
USF1MA0093.2chr25:25011632-25011643GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr25:25011630-25011646ATGTCACGTGACCTTC-6.02
ZNF384MA1125.1chr25:25012096-25012108GTTAAAAAAAAA+6.04
ZNF384MA1125.1chr25:25012097-25012109TTAAAAAAAAAA+6.44
Enhancer Sequence
GGGTTTGACA TTTATTTAAT TAAAATATAT TTGTATAAAT AGTGAATGAG TGAGAAAGAC 60
AACCAAAGTA ATGCCAAAAA TGTGTGCTTT TATTTACAAT CCCAAAGTGA ACAACAACAA 120
CGAATTAATC AAAAATAAAG AAAAAGTAAG TAAAGCAAAA ATATTCTATT TACAATATGT 180
ACAACACTGA AACAAATAAA GACGGGGAAA ACAAGAGAGC TGGCAGAAGG GACGCGGGCG 240
GCGCTAAAGA AATGAAAAGA ACAAAACCCA AACTAAATCT AACTTCCCAG AAGCATCTAG 300
CTAACTATCT ATGTAAAAAC AGTATAATTA ACACACGAAG ATCTTCCGAG TCCTAACTAT 360
CTACTCTATC TATCTATCCA AAAAGTACAA GGAGTGGCGC TCGCCCCTAA CCTAATGTAC 420
TAGACAGCAG AGTAGTCCTG AGTGTTGCAA AATGTATGTC ACGTGACCTT CTTACCTGTC 480
CGCTTCGTCC AAGCCTCGTA AACAACGATA AACTAAGAAC AATGTACGAA TAACGGACGG 540
ATAACGTGCA CACAGAAACA AGCAACAACA AAACACAGTT AGACGGGGTT ATTTCTAAAC 600
GCACGCGGTA AATACAAACA AGCGACGAAA CAGCGAAAGA GACAAATGCA AGCAAGAAAG 660
CAAGAAAACA AGAAAGAGCG AGTGGTCTGG CGCGCGCTTT TAAGACGGGT GGTCTTTGCT 720
CATTGGATGT GACGTAAAAG TGACGTAACC GGGGAGGAAT GACTGACAGC TGAATGGACC 780
AATGAACAGA ACCTGAGAAT ACATGAGAGC AGATACGGGA GAACAGAGAG AGAGAGAGGG 840
AAAAAACACA GAGAAAACAG AGCACAAAAA ACACAAATAC ATAACACTCC CACCCATGAG 900
AACAAACATA TAATATTGTT TGTTAAAAAA AAAATTGTGA AATAGTAAGA AAAAAAAACT 960
CGCAAAACAA ACCCTGCGGT TTAATT 986