EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23404 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:23882465-23884768 
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr25:23883087-23883099TAAGTAAATAAA+6.07
FOXC2MA0846.1chr25:23884288-23884300TAAGTAAATAAA+6.07
GRHL2MA1105.1chr25:23884365-23884380CAGAACTGGTTTGAC-7.33
HOXA10MA0899.1chr25:23883643-23883654TTTTTATTACT-6.14
MEOX1MA0661.1chr25:23882468-23882478GCTAATTAAC+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:23883543-23883553ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:23883543-23883553ATTAATTAAT-6.02
SIX1MA1118.1chr25:23883175-23883186GAAACCTGATA+6.32
SIX1MA1118.1chr25:23883700-23883711GAAACCTGATA+6.32
ZNF24MA1124.1chr25:23884429-23884442CACTCATTCACTC+6.01
ZNF24MA1124.1chr25:23884163-23884176TATTCATTCATTC+7.52
ZNF24MA1124.1chr25:23884167-23884180CATTCATTCATTC+7.82
ZNF24MA1124.1chr25:23884171-23884184CATTCATTCATTC+7.82
ZNF384MA1125.1chr25:23883024-23883036TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23883025-23883037TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr25:23883026-23883038TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr25:23883990-23884002TTTTTTTTTTTA-6.37
ZNF384MA1125.1chr25:23883028-23883040TTTTTTTTTAGA-6.52
ZNF384MA1125.1chr25:23883456-23883468TTTTTTTTTAGA-6.52
ZNF384MA1125.1chr25:23883992-23884004TTTTTTTTTAGA-6.52
Enhancer Sequence
AAAGCTAATT AACATCATTA AAAGGCTTAT TTACTTAAAG TAATTTAAAA TAATCACCAT 60
ATTAAACAAA AAATAAAGAT TTTATTTTTG GGGCAACCAC ACAAGCACAC GCAAACACTA 120
TTTTGATCAA CAGAAATGTA GTGTGTTAAA CAGTATACAG CTAACATTGC TATTAAATAC 180
ATTTCAACAA ATATAATCGA CAAAGGAATA TAAGCACTAA ACATACATCT TACAAAGGCA 240
ATGTTTTGTC GTGTAAGCAG TAATTATGCA TTTAAATACA TAAATTGATT TACCTGCTCT 300
CCCTGGAGAG ATGAGTTCGC GGGAAAAGGC GTCTCCAATT GATTGCGTCA TTAGCACGTG 360
TTTGCAAATG CCGCGCGTTC ATGAGTTGAA TGAGGCGCTG TGAGGGATGT GTGCTTAACA 420
CACACACACA TACACATGAA CAGAGGGGTG GGGGAGGGAA ACTGCAGCAG GTTCAACTTG 480
GAGTTTGCAA AATGTATGCA TCCACGTGTT GAAGTGTTCA CATATTTGTT TTATATTGAA 540
CATGCTCTTT TCATTTGACT TTTTTTTTTT TTAGAAAACC TGATTTTCTT TGATTATGGT 600
GCACTTTAAT ATAATCTCCA AATAAGTAAA TAAATAAATA TATATATAAT AAAAAATAAT 660
TATAAAATAA AAATATATAT ATATATTTTT AAAGTAAAAA AAAGTGAGGG GAAACCTGAT 720
AGGTGTTGTA GACTAGAATT ACGTTAACAA ACTAATTTTA TATTGTCATC GTCATCATAG 780
TCATAGTCTC TACCCCAGGG CAGCTCTCAC GAGGCGTCTG AGTTGACAGT GGGGGATGGG 840
TGCTCAAGAC ACACACACAC ACATAGAGGG GTGGGGAAGG GGAGCTGCAG CAGGTAACAC 900
ACTTCAACTT GGAGTTTGCT AAATGTATGC ATCCACGTGT TGAAGTTTTC ACATATTTGT 960
TTCACATTAA ACATGCTCTT TTCATTTGAC TTTTTTTTTT AGAAAATCCG ATTTCTTTGA 1020
TGGTGCACTT TAATCTCCAA ACAAATAAAT AAATTATATA TATATATATA TATAATTTAT 1080
TAATTAATAA AAACAATTGA TATAAAAACA GAGATTCTTA GCGTTTTAAC ACAATCTTAA 1140
GGCATGTTTT CAACATGCTT CCTGATCCAT CAAACATGTT TTTATTACTA TATATATATA 1200
TTTATTTATT TTTTTAAGTA AAATAAAAGT GAGGGGAAAC CTGATAGGTG TTGTAAACTT 1260
GAATTACATT TACAAACTAA TTTAATATTA TTGTTATAGT CGTAGTCTAC CCCAGGGCAG 1320
CTCTCTTGAG GCTTCTGTGA GTTGACAGTG GGGGATGGGT GCTTAAAACA CAAACACACA 1380
CACACACATA CACACGAACA GAGGGGTGGG GGAGGGGAGC TGCAGCAGGT AACACACTTC 1440
AACTTGGAGT TTGCTAAATG TATGCATCCA CGTGTTGAAG TTTTCACATA TTTGTTTCAC 1500
ATTAAACATG CTCTTTTCAT TTGACTTTTT TTTTTTAGAA AACCCGATTT CTTTGATGGT 1560
GCACTTTAAT CTCCAAACAA ATTAATACAT TTCTTTATTT ATTATCTATT TATTTATTAA 1620
TAATAAACAA CTGATATAAA AACAGGGATT CCTGATCTAT CAAGCATGTA GTTTGTATTT 1680
CTTTTTTTTT ACTATATATA TTCATTCATT CATTCATTCA TGGGGTCGCC ACAGCGGAAT 1740
GAACTGCCAA CTTATATAGT AAAAAAATGA AATACAAACT ACATGCTTGA TAGATCACAT 1800
ACACATTTTT ATTATAGGTT TTTTAAGTAA ATAAAAGTGA GGGGACAGCA GACCCTCAAT 1860
TTAACCTCTA AACACATCTG ATCGTACTAA TTTGAGCTTC CAGAACTGGT TTGACACAGT 1920
ATCACCAGTG ATAAAATCAA TCTCTAGTAA CTCACTCACT CACTCACTCA TTCACTCACT 1980
CACTCAGTAT CCTTCAGCAT AGTTACTGAT TTATCAGGGG TCGCCACAGC AGAATGAACT 2040
GCTAACTACT CTGGCATGTT TCCTACAGCA TGCCCATCTG CTACACCACT GCCTAATCCC 2100
TACCCCTAAA CCTCACTCAC TGACTCACTC ACTCACTGTC CTTCAGCATA GTTACTGATT 2160
TATCAGGGGT CGCCACAGCA GAATGAACTG CTAACTACTC TGGCATGTTT TATACAGCAG 2220
GCCCATCTGC TACACCACTG CCTAATCCCT ACCCCTAAAC CTCACTCACT GACTCACTCA 2280
CTCACTGTCC TTCAGCATAG TTA 2303