EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23334 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:20483321-20484299 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
POU1F1MA0784.1chr25:20483408-20483422TGTATGCAAATTAG+6.28
POU1F1MA0784.1chr25:20483442-20483456CTCATTTGCATATT-7.82
POU2F1MA0785.1chr25:20483444-20483456CATTTGCATATT-6.74
POU2F2MA0507.1chr25:20483442-20483455CTCATTTGCATAT+7.52
POU3F1MA0786.1chr25:20483443-20483455TCATTTGCATAT-6.18
POU3F2MA0787.1chr25:20483409-20483421GTATGCAAATTA+6.04
POU3F2MA0787.1chr25:20483443-20483455TCATTTGCATAT-6.37
POU3F3MA0788.1chr25:20483443-20483456TCATTTGCATATT-6.02
POU5F1MA1115.1chr25:20483444-20483455CATTTGCATAT-6.32
Pou2f3MA0627.1chr25:20483407-20483423ATGTATGCAAATTAGC+7.35
SOX13MA1120.1chr25:20483769-20483780AGCCATTGTTT-6.14
Enhancer Sequence
GTAAAAATAG ATGAACAATA TCCCCTGTGT AAAAATGTTA TTATGTCACA TTAATAAAAC 60
AATAACTCTG AAAATGACTT CATTCGATGT ATGCAAATTA GCTCATTGAA TAAAACAGGC 120
ACTCATTTGC ATATTTAAAC GAAATCTTTA AAAACCTACA AAAAAACGTA TGAGCTGGGA 180
AAGTATTATG AAAACTAGTA TCCTAAAACA CCTTTTACCT GCAGTGTCTT GCCCTTAAAA 240
AAAATAAAAC ATCACCGATT CATGGTTATG ACCAAACAAA TAAAAGCGCT GAGTCTTACT 300
TCTCCTCCGC CAGCTGTTGT TGGTACTGCT CGAACTCTTC TTGGGTCATT CCTTTCGCCG 360
CAGCTTCAGT CTTTTCCCCT TCAGGTTTCT CTTCTAGACC CCCGGTAAGA TCCTTCAGCT 420
GCCCTCCTAT CATGTGTTTC AACATAAAAG CCATTGTTTA TCACAATATA GACTGTTCTT 480
CAATAAATTC CTAACGTTAG TCGCGGGGAA AACTCTTTCG TCACATTAAT GTCTAACGTT 540
ATGTGTCTCG CGTGAGGGAA AACAAAAATG CGACAACAAA AAGTAGCCTA CATTTGTCAT 600
CTGCTCTCAG TTCAAGTTTC AGCCCCACCA TTTAGAACCA ATACAAAGCG GAGGAACTAA 660
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT 720
CTCGCTCTCT CTCTCTCGTA ACGTGCGACT TGACGCTTCA TGACATCGCA GATAAACAAC 780
TTGAACATCA TAAGATACAT AACCTACTGT TTTATGCTTG CTGTTGCTGT AAATATAATA 840
CATACATGGA TATCATATAC AAATAAAAAA ATAGCCTATG ATACGACCTA GCTAAACACA 900
AATCACTTCC ACCAAGCAAA GTGAGCTCTG AATGTGTTGT GTACTGTGTA CAGTGTATCC 960
ACGTTGATGA AACGTCTT 978