EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23332 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:20425412-20426428 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr25:20425579-20425595CCTTAAGTAAACATAA+7.24
FOXC1MA0032.2chr25:20425582-20425593TAAGTAAACAT+6.02
FOXC2MA0846.1chr25:20425582-20425594TAAGTAAACATA+6.27
FOXD2MA0847.2chr25:20425580-20425593CTTAAGTAAACAT+7.22
FOXE1MA1487.1chr25:20425579-20425594CCTTAAGTAAACATA+6.04
FOXF2MA0030.1chr25:20425586-20425600TAAACATAAACAAA+6.3
ZNF384MA1125.1chr25:20425951-20425963AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:20425952-20425964AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:20425953-20425965AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
AGTTTTAGGG ATGAGTAAAT GACAGAATTT CAATATTTGG AAAACTTATC CTTTTAAATA 60
TATGAAAGTT ATGTCAATAA ATGCACAAAA AGGTTATTGC TTCTATGTTG TTTTCCACAC 120
AAATATGGTC AAATACGGAG TAAATGACAG AATTTCACTG TTTTGACCCT TAAGTAAACA 180
TAAACAAACA TTGTTTTAAT ACGTTGTATT GCTGACGCTT AATCTAACAG TTGAAAGAAC 240
TGAGTCAGAC TTCAATCAAT GCCTTAAAAC GCGTCTTGTT CAACTCATAA ACATGACTTT 300
CTGCATTTCT ACTTGAACTA CACATCGAAT TAGACAAAAG CACCGTCCTA TAGTTAAACT 360
AGACAGTTAA ATGCCTTCAA AACTGACGGT GCTGACCGCG TTTCCACTTC TTCACTCAAT 420
TTCCGTCTCC TCACACACTT CTCCTCAGCA CCGCGGTCCA GACTCGGACA CATTTACTTT 480
CTTCCTCTTT GAAGCTCGAA TTTCTCGCCT GCAGGACCTA TTTCTACTCT TTCCTGTGCA 540
AAAAAAAAAA AAACCGTTGG CACATGCAAC ACTTACCTCA ACAATCTTCA TAAGGCTCAA 600
ATGTGCCGCT GTAGGCGCTC CACTTCTTTC GGGCAGGCTG AATTCCGCGG TTTAAATTTC 660
AGCACCGAGT TATAACTGAA GCATGGCACG TAAATAAAAC GCAGCCCGAG ATAAAACGCC 720
TGTCCGCGGT CGGAGTGTAA CTTTAAAGCG ATTGGAGCGG CCGATTGGTG AAATGTGAAC 780
GGTCTCGCGT TGCTCGTGCG TGTTGTTGGG CGTGTGCGCG CATCCTGTGC TTCTATTCTC 840
GCGCGCTCTC TAGGGACTCC GATGATGCTG CTGATATTGC CAAGCAACAG CTTCTGTAAT 900
AACCCGTCAA AGTCTGACGA CACGCAAGTT TGGCATGTTT TATAAAGCGT TATAATTCGT 960
TTTGGCTTAA GTGTCATTTT TCTTAATCGG GCATTAAGGA AGATATCTCT CTAATT 1016