EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23151 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:13606270-13607656 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ARNT2MA1464.1chr25:13606745-13606755GTCACGTGCC+6.02
IRF7MA0772.1chr25:13606592-13606606ACCAAAGCGAAAAT+6.31
LMX1BMA0703.2chr25:13606278-13606289AATTTAATTAA+6.32
MEF2AMA0052.3chr25:13606393-13606405TCTAAAAATAGC+6.52
MEF2BMA0660.1chr25:13606393-13606405TCTAAAAATAGC+6.22
MEF2DMA0773.1chr25:13606393-13606405TCTAAAAATAGC+6.14
PHOX2AMA0713.1chr25:13606277-13606288TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr25:13606277-13606288TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr25:13606277-13606288TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr25:13606277-13606288TAATTTAATTA+6.62
RUNX3MA0684.1chr25:13606479-13606489AAACCGCAAA+6.02
SP1MA0079.4chr25:13607470-13607485GGTGGGCGGGGCTTT-6.6
SP2MA0516.2chr25:13607469-13607486CGGTGGGCGGGGCTTTT-6.68
SP4MA0685.1chr25:13607468-13607485TCGGTGGGCGGGGCTTT-6.04
Enhancer Sequence
ACAATAATAA TTTAATTAAC CTTTTTGATA TTTCTACAAA TATATGCATA GGGTTTTGAC 60
AGTGGTTTTG CCTCTGCATC CATGTCAAAA ACATGGGAAC GTTAATACCA TTTACTGAAT 120
GTGTCTAAAA ATAGCGTAGT ACTTTATTGT CATCTCATAT TTAACTAAAT ATAGTCGTAT 180
ATTTCATATT TCGCAAAGTG AGGAATTAAA AACCGCAAAC AATTTAGTCA GTATCTTCTC 240
AAGAACAATT ACGAAACGGG TGACAAAAAA ACAAGAGTCT ACTTTCCCCC TTGTGTCATA 300
TGACCGCGTC ATATGAGAAA CCACCAAAGC GAAAATAAAC AGACAACAGA AGAAAATGCT 360
AGAAAACAAG CCGACCGTAT CTTCTATGAC CCAAACACAG CTACTGAATG TACTCATTTT 420
ACACTTTTAG ATGGATATGT TTTAGTTTCT TCGATATGAA AAAAATCATG CCGCTGTCAC 480
GTGCCACAAA CTGTTCTTAA CGTACCTACA AATTTCAAGT TTACGTTTAA CTGTTTTTAA 540
GAATATGTTA AGCTAACAAC TAAATACATG GCTATAAACA CATTCATGTA TTAAACATTA 600
AAATATAGAT ATGAAGTTAA AACCGACTAC TGTACATTCT GTACCAGTGG CCGTGACACA 660
AACACGCTAC CAAGACAACA CAACTACTTG GCAACAAAAC AAGCGCGGAC GGCAAAAGTG 720
TCGCCTAGGT AGGCAGCGCA CTAGAGTTTG CGACGCCTCC CGCATGACAG TTTATCATGA 780
GACAAGTAAA CAACCATTGA TTTGAGTCAC AAATGCAACA GGACATTACA ACACAAAGGA 840
TATTCTGTAA GGAACCTACT GAGAACCACA GGCGGCCGAA CTGAGCACAC TTTTCCAGGA 900
GGGCATTTCA AACTTCTGCC TTCGGTAAAA GACACCACCA ACAACAACAA ACACAGCTGG 960
AGCGACGCGA GGATCAACCG ATGGCTGGGA AGCATCTCTT TCGGCGGATC TGCAGGCTGA 1020
CAGCGTAAAC GGTGTTTATC TGTCCATCTT GAAGGGGTGA AATGAGCTGA GAAGTAGCGT 1080
TTCTGGGTCT GTGCAGCAGT GACAGTGTGA TGATGATGAA GACAGACAAT ACGGCGATCA 1140
AGCAATAGGT GTTTTTAAAG CGGACAGACG AGATTAAGCG ATGGCCGAGC GCATCGAGTC 1200
GGTGGGCGGG GCTTTTGGAT TACAGCAGAT GGATGGAACA ATCCATTTTT TGATTTCAGC 1260
ATAATAATAC TTTCAGGGGT AAGTATTAGA ATATTTTGTG TGCAGCTTAT TGTTTTAGGA 1320
GGTAATGAAT GTTTCAAAAT GAACAGAATA ATCTTTCGTC AAATATTTTC TTACCACAAA 1380
TCACGA 1386