EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23130 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:13169832-13170994 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr25:13170775-13170792TGAGTTAATTAATTCGT+6.59
Alx1MA0854.1chr25:13170774-13170791GTGAGTTAATTAATTCG-7.1
Alx4MA0853.1chr25:13170774-13170791GTGAGTTAATTAATTCG-6.68
EOMESMA0800.1chr25:13170514-13170527AAGGTGTGATAAA+6.23
Foxq1MA0040.1chr25:13170760-13170771TATTGTTTATT+6.62
Lhx3MA0135.1chr25:13170777-13170790AGTTAATTAATTC-6.15
Enhancer Sequence
AGTCTAGGGT TGGGACAACA ATGTGTGTTT AAGAAATGTT TAGTGTTGTT ATAAGAGTTA 60
AATAAAAATG CACTAAATTT TCAGGAGTGA TGTTTTGTAT GATTATTTAT GTCAATGTAT 120
CTGCATTTAG ACATAAGATT TTTTAGAGGC AGTCAAACAA ACATTAATAA ACTTTGTAGA 180
ATAAATATTG ACTGTTGTTT ATTTATGTGA GTTACAATCA TAGACCTGCA CATTTTTAAG 240
TAGATATAAA AATATATGAC TATTAAAGTA CAGTTACATT CATTCTTTGT TGTAATAATA 300
ACAGTACCTA AAAATAAAGA ATAAAAACTT TTATTATACA GAATCCAGTT TAAAGAGCTT 360
AGTTTTACCA GTTTGTTAGC AAAGCAATAT TTATGCAGTG TCACATCCGA GGAACTGAGT 420
GTCTTTGAAA ATATTATGTG CAGTTTACAG TTTAAGAATA AAAGCATATT TATTTAAAAT 480
TTAGTTAGCA AAAATTGTAT CAAACAAATT ATTGTTTGGG CCTTAAATGG AAAAGTTTCT 540
TTGGTCAGAG TTTCTTTTGT CAAAGTTTCT TTGATCAGAG TTTCTTTTAG ATTAGGCAGG 600
GTCCACAGCC CCACACCCCT GCTGTTTTGA AACTCAAACA CATCAGTGTA AATGGGGCCT 660
GGGATTTTCA CAGATAAAAC CAAAGGTGTG ATAAAAGTGG TGTGCATCAA ACCCATTCCC 720
ACACCTCTCC AATTAAGCAC AAAAACTTGA GTTTGAATCA AACAATGTCT TTGTAACTTT 780
TCCATTCAAA TTGTGAATCC TGAATTACCC AAATTCTTAT TTTGTATAGT TTTAATGTCA 840
AGGTATTTGC ATTTGGACAT AAGATAAGTA TTTATTTTCA AGAGCAGTTA AACTAACATT 900
AATAAAGTTT GCAAATGAAA ATATTGATTA TTGTTTATTC ATGTGAGTTA ATTAATTCGT 960
TAATTTTAAG CAACTGTTTG GTAAACTGTT GTTGAAACAT GTACAAAAGG AATGTAAACC 1020
TGATTTTTTG GTCATTTGAT AAATGCTTTG GGCATTTTTT TAAGTTGATA TATATAATTT 1080
TACTTTATTT CTTTGTCCAT TGTAATAATA AAAACAGTAT ACTTTTATCA GTATACGTAA 1140
TTGTCATTCA AACTGTGAGC TT 1162