EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23123 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:13132950-13133842 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr25:13133386-13133405CCGTCACTAGGTGGCGCTA+6.48
CTCFMA0139.1chr25:13132986-13133005CTGTCAGCAGGTGGCGCTA+6.51
CTCFMA0139.1chr25:13133124-13133143TTGCCAGCAGGTGGCGCTT+7.38
CTCFMA0139.1chr25:13133255-13133274CTGCCAGCAGGTGGCGCTA+8.36
CTCFMA0139.1chr25:13133691-13133710TGGCCAGCAGGTGGCGCTA+9.81
IKZF1MA1508.1chr25:13133116-13133128ACTTCCTGTTGC-6.04
IKZF1MA1508.1chr25:13133813-13133825ACTTCCTGTTTT-6.74
SPICMA0687.1chr25:13133812-13133826GACTTCCTGTTTTG-6.22
Enhancer Sequence
AGCCGAGAAA ATCACACATT TATGCCAAAC TTCCTCCTGT CAGCAGGTGG CGCTATGACT 60
GTGACTCAAG ATATGTAAGG TATGTAGATG CCTTCAGTAG AGGAATCTTA TCAACCATGT 120
GAATTTTCAG GCAGGTCGGA CGTTGTTTGG CTGAGTTATA AGCCAAACTT CCTGTTGCCA 180
GCAGGTGGCG CTTTGACTGT GTTAATGTTG ATATGTTGAT GTCTTCAGAA GAGGATTTTA 240
ATCAACCATG TGAAGTTTCA GGCAGATTAG ACATTGTGGG GCTGAGTTGT AAGCAAAACT 300
ACCTTCTGCC AGCAGGTGGC GCTACGACAG ACTCAATATT GTTATGTGGA TGTATTCAGG 360
AGAGGACTTT TATTCACCAT GTTAAGTTTC ACGCTGATCG GACATTGTGT GGTTGAGTTA 420
TAAGGCAAAA TTCCTTCCGT CACTAGGTGG CGCTATGACT GACTCAATAT TGGCATGCAT 480
ATGTGTTCAG GAGAGGACTT TTATCAAGCA TGTGAAGTTT CAGGCTGATC GGAAATTGTG 540
TGGTTGAGTT ATAAGCATTT CCTGTTCCAT GGCGAAGCGT TGAGGTTTGT CATGCCACAA 600
CGGACACGCC TTTCTGCGAA AACTCTAGAT ATTCACAATA TATCATCGCT AGAGCTTTCA 660
GATGACACCA CCCAAATTTG GTGCTGATAC TATAACATTT GTGAGAGGAG TTCATTACAG 720
TGTAAAACAT GTCATTTCCT GTGGCCAGCA GGTGGCGCTA TAACTGTAAC TGGATATCGG 780
CATGTAAACG TGTTCAGGTC AGGACTCTTA TTAAACGTGT GAATTTTGAG GCAGATCGGG 840
TGATGCATGC CTGAATTATA ATGACTTCCT GTTTTGTGGC GAATCGTCAA GG 892