EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23077 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:12257366-12258419 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr25:12257596-12257615TACTGTCATCTAGTGGTAA-6.17
NFIL3MA0025.1chr25:12257961-12257972TTATGTAACAT+6.32
ZNF384MA1125.1chr25:12257917-12257929TTTTTTTTTATT-6.62
Enhancer Sequence
CCATACTGCT TCTATAGCTA CTCTAAGAAC CATATCCATC AGTATATAAG CTTGCGACGA 60
TTATTTTAGA CTTTATGAAT AGAGTACATT AAATCTGACT CATGTAGATA AGAAATACGT 120
GATTTTATGT CTCCGTTTTT CCCTCTCAGA TTTGTGAAAT CAGTGCAAGT CTGAGTCACT 180
GTGTTCTACT GCGGTCATGG AGTTACTCGT AATGTACTTT TAAAGCGAGC TACTGTCATC 240
TAGTGGTAAC ATTAGGAAAG ACAGACAACT TCATCTTTAT GAATAATGTA TTCTGATTGC 300
ATAAATGCTA AAGCGCAGCA TAAAACCACA GTGTAGCATG TGACAAGTTA TTTTATACGT 360
GTAACTGCGT CTGTTTTTCT TTGATCAAGA TATGTAGTAA ATAAATGATC AAATAATATG 420
CCTTCAAAGT AGAACACAAT GGTTTTATTA ATGTTTTAAT TATCAAAGTG ACACTCCAGT 480
CAATGAAATA ATAAACGGGT AGTGCTTGAG ACGAACCACG CGGGGGCGCT GTCATTCGAT 540
TTTAATTTTT GTTTTTTTTT ATTCTTTAAT TTCCCCCCCA TATGCAATGT CGTGCTTATG 600
TAACATGCAT AAATGAAAAA TTAATTCCTT TCGTTTAGGC TTCTGGTTTT TTCCCACATC 660
CTAGACTGAC ATTGCAACAA CAAACACACA CACCACTCGT CGAGCCTGCA GTTTCTGTAT 720
TGGTGTAACG GATCTCCACA CAAAACGGCT ACCTTTAATT GAGTTTTATG AAATGGTCAA 780
ACAGCAGGGA CCGCGGGGAT TATTGTTAAT GCACGTCGAG AGCCTTTTGT GTAAGCACTG 840
TCAGGAATAT TTATTTATGT GTAATTGTGG CTGCCTTCTT GTGCATTTCC AATAGACCCC 900
ATGCCGGCTT AGGAATTATT CAAATTAAAA GCATTTAATG ATGAATAAAC ATGTCCTGAG 960
CACGTGTTTA ACACTGTTTG CAAACAACCA ATAACTGATT CGCACTTTGC ACACAGAATT 1020
ATATAGATCT ACAATTGAAG TCAGAAAGGT TAG 1053