EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23074 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:12169829-12170812 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr25:12170485-12170498GAGGTGTGAAAAC+6.78
FOXE1MA1487.1chr25:12170332-12170347TTTGTTTGTTTTGCC-6.04
FOXE1MA1487.1chr25:12170628-12170643TTTGTTTGTTTTGGA-6.16
KLF14MA0740.1chr25:12170451-12170465GGACACGCCCACTT+7.06
PHOX2AMA0713.1chr25:12170277-12170288TAATTAGATTA-6.32
POU1F1MA0784.1chr25:12170267-12170281ATTATGCAAATAAT+6.08
POU2F1MA0785.1chr25:12170387-12170399TATATGCAAATT+6.18
POU2F1MA0785.1chr25:12170267-12170279ATTATGCAAATA+6.32
POU3F1MA0786.1chr25:12170268-12170280TTATGCAAATAA+6.07
POU3F1MA0786.1chr25:12170388-12170400ATATGCAAATTT+6.32
POU3F2MA0787.1chr25:12170388-12170400ATATGCAAATTT+6.18
POU3F3MA0788.1chr25:12170267-12170280ATTATGCAAATAA+6.28
POU3F3MA0788.1chr25:12170387-12170400TATATGCAAATTT+6.59
POU4F1MA0790.1chr25:12170262-12170276TATTAATTATGCAA-6.56
POU4F2MA0683.1chr25:12170260-12170276TTTATTAATTATGCAA-6.85
POU4F3MA0791.1chr25:12170260-12170276TTTATTAATTATGCAA-6.97
POU5F1MA1115.1chr25:12170388-12170399ATATGCAAATT+6.62
PROP1MA0715.1chr25:12170277-12170288TAATTAGATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr25:12170277-12170288TAATTAGATTA-6.32
SP4MA0685.1chr25:12170449-12170466CTGGACACGCCCACTTT+6.7
SP8MA0747.1chr25:12170452-12170464GACACGCCCACT+6.37
TBR1MA0802.1chr25:12170486-12170496AGGTGTGAAA+6.02
TBX2MA0688.1chr25:12170485-12170496GAGGTGTGAAA+6.14
ZNF384MA1125.1chr25:12170598-12170610AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr25:12170599-12170611AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
GTGTCTACAG ATTTGGTAAT TGAGCGATTA GTGGTCTTTG TTTGTTTATT CAGAGGCAAA 60
GTTAGTTCGT ATCGTCAGCA GTACTCTTTC AGGGTTTAAA GATGGACCTT AGTCAAATGA 120
CTTCTAAGTT AATAAAGTTT ACCTTACGTT AACATCACTA CAATATTATG GACTGAAAAA 180
TATGCTGTAA ATGCGTCTCT CTCGAGTGTA AACGTGTAAG CACCACAACT TTTGCCACAT 240
TTTGGGGCAA GAATAACACA CACACCTTTC TGACGCTACC TACTGAGTGC ATCTAAGTTA 300
CAGAGAAATG CGGAGGGTTT TTTTTTTCTC TCATTCATAT CAATATAATG TTAGTTAAAT 360
ATTTCATTTG TCACAAGGGG CATGAATGAA ATTCCTGAAT GAAAGAGCCA AACTGCAGTT 420
AAAGTCCACT ATTTATTAAT TATGCAAATA ATTAGATTAC TGATATCCAT GTAAACACAG 480
TCACTGTCCT TCTCCTCTGC GTCTTTGTTT GTTTTGCCTT CGTGAAAATC AGCGCGTGCC 540
TAAACCAACA CTCCCATTTA TATGCAAATT TTTACGGACC ATGCCTTTTT CCCTCCTCCG 600
ACACTCCCCC CTAAACAGAG CTGGACACGC CCACTTTCCT GACTTTTTCC AAAGTAGAGG 660
TGTGAAAACA CCCTGCTGGG TTTCATGGCA CACATGCACA TTTTGTAGTA TCACATGAGG 720
AAAGGAGTGA TGAAAATGGC AAAGTTTAAA TAAAAATCCC CTAATTAACA AAAAAAAAAA 780
AAGTTTGTGC ACTTTTTTTT TTGTTTGTTT TGGACCACAA AAAAAGGTTA AAGGGAATAA 840
TGGGGGATGG AAACACATTT TCTGAATATG CGTCTCTGTT GACCCTTTAC ACATTAACAG 900
GTTTCTCAGT AGGAAGTCGT CAAAGTTGGC TAAACTTAGA GCACCACAAT GGTGTTATCA 960
AGACTTTCAG AAAAAAAGAA AAA 983