EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23060 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:11013024-11014352 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr25:11013195-11013214CGGCCACCAGAGGTCAGCC+6.51
Foxd3MA0041.1chr25:11013461-11013473GAACAAACATTC-6.14
LMX1BMA0703.2chr25:11014304-11014315ATTTTAATTAA+6.62
SOX21MA0866.1chr25:11013957-11013972AACAAAGTCATTGTT+6.05
Enhancer Sequence
AAAATGTTTA TGATTTTTAA TTCTGAATTC TTGAATTGTG TTTACAAATT TGATTTTGTC 60
AATGTGATTT GTGCTGTGCA TGTATGAATT TCATTTTGAA AAGTTATTAT TTTTTAGACT 120
GATCTGGCTC CAAATTTAAT CCAGTCCGAG GATCCCTTGT AATAATTCAA CCGGCCACCA 180
GAGGTCAGCC AATATCATTG TATATATTTC CAGTGGGCAT TGAGTTTCAA ATACGAAACA 240
CTTGACAACT AAAAAGAACA CACTGGCATT CAGCAATCGC TTCATAAACA GACAGTCATC 300
ACTTATAAAT ATCCATGAAT TAAACAAATG AAACATTTAA ACGCCACTCA AACACTATCA 360
AGGCCAAACC CTAAAATTAA CCCCAAAACA TCACATTAAT AACTCCAAAT ACCTACAACA 420
AAACGGAAAA TAAGTTTGAA CAAACATTCT ATTGAAGCCG GTTGAATGAA CACACTGTCA 480
GGCATGCGAC AGTCAGAGTC GGTAAAGAGA CACTGCTCCC AAAACTGCTG GTCCCGCCCC 540
TATCAGACAT GCGGGCTTGA AGAATAGAAG TTGCTACAGT GGAACTAACA AAGTGATTTG 600
TGTCTCTACA TTTCTGAGAC CTTTTAAACT CGTCAAATCC CGCAGCGCCG AATAAAAGCT 660
GCAACACTGT AATGCTCGAG TTGTTTAGTT ACATTTTAAA GCGTTACTTC CAGTCAGACG 720
CAACGTTGTA ACTCAGTAGT TTGCCTCGAG ACGTCCACAT TGAACAACTT GTTGGATTGA 780
AGCACAGTTT GGCGTGTTTG GGGTAACCAA CCAGAGTCCC AAAAGAAACA ATGTCGGATG 840
GGGATTTGTG AGCTTTTAAA AGGAATGAGA GTGAACCAAA GAAGCACGCT TTGAGCAGTG 900
CAGCGTTCGA GGTAAGATAT ATTTGAGTTT CCAAACAAAG TCATTGTTAT ACGATGTTAC 960
CAGGGGTCGA GGGTTTGTGT TTAGGGGGCA GAATTTTGTT TTAGTCACAT TAACCTGCAA 1020
CGACAAGTGA AGTCCTGCTG GTAGAGCCAT CTTAAATTAA CTGTACCTTT GTCGTTGTAT 1080
CTGGTTTCTG GCTGGCCTGT AACTGTATCT CATGTCATTT GTTTTATTAC TAATGTATTT 1140
ATTGAGTTGA TGTTAGTTAT GAAACAAGTA ACGTTAGAGT ACTTTCTAAA TAACTCGATT 1200
TTTAGGTACG TTTTTTCCGT ATGACATTTA TAACTAATCG CAAACAGTCG TCGTAATAGT 1260
CGCACTATAT TGGAAATGTC ATTTTAATTA AATACGTATG TATTGGTCAG ATGGTAGTTT 1320
TAGACAAG 1328