EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-23017 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:8891090-8891975 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HAND2MA1492.1chr25:8891225-8891235AACACCTGCA+6.02
KLF13MA0657.1chr25:8891592-8891610TGGCCACGCCCACTTGCT+6.02
KLF14MA0740.1chr25:8891593-8891607GGCCACGCCCACTT+8.12
Klf12MA0742.1chr25:8891593-8891608GGCCACGCCCACTTG+6.48
PBX2MA1113.1chr25:8891579-8891591TTGATTGACAGC+6.32
SP1MA0079.4chr25:8891591-8891606GTGGCCACGCCCACT+7.06
SP3MA0746.2chr25:8891593-8891606GGCCACGCCCACT+6.92
SP4MA0685.1chr25:8891591-8891608GTGGCCACGCCCACTTG+7.31
SP8MA0747.1chr25:8891594-8891606GCCACGCCCACT+7.22
Sox1MA0870.1chr25:8891245-8891260AGCAATGCTATTGTG-6.82
Enhancer Sequence
TAACAAGTGT AAATCAGTGT AAGCTGGTAA AATACACAAC AAACAATACA CAAAGTTTCT 60
GTATTGCTGT CATAAAACCT ATTTGCAGAG ACAGGCAAGC AGAAATCTGT TAATTATCTC 120
CTCTGCTAGT AATTGAACAC CTGCATGCAG GTGCTAGCAA TGCTATTGTG TGTATTTATA 180
ACCACTTTTC TGAGCTTTAG AGATAACAAG CCGAAATACC CCACATTTAC ATGAAAAAAC 240
GGCATATTGC TAACTTGTTT TGCTAAAAAT TCGCAACTTA CTGAGTCACT GCAGGGGCGA 300
GACAGGGACA TCACCTTTGA AACATACCCT AATGTGTACA TTCATGGTAT TATTCGCATC 360
CTTTTATAGC GCTACAAACA TATGATGAGA AAGAAAATAT ATCTCTGTTC TGCTCGGGAA 420
ACATACCTCA GTCTGTAATT GGTCGGAGGC GGCCATTTTA ATGGTTCCTC TTTAGCCGCG 480
CCAGTGGGAT TGATTGACAG CGTGGCCACG CCCACTTGCT CAGCATGTGT TGCTACGTGA 540
GGCCTCAGCC CTGGCGACAC TCTTCATATC AATTAAAGCC CAATTAGGGA GCCATGTTCT 600
GCTAATTATG CCACGCTTCA CATTCCCAGA ATAAAGTGAG CGTGTGTTTA CTGAGATAAA 660
TAAATAAAGA CACGGGCTGC CAAGGCGAGC CGACCTTAAT CAGATTTTCA GTGCTTTCTC 720
TCTCTCTCTC TTTATGTCTA TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTTTTTCTA GCCTGTGATC 780
AAAACGGAGG TGTAATTATA CGGCTTCACC AATTGGTGAC AGTGTTGTAA CATGTCTTGT 840
GTAAAATGCA GCAATTCCAT GTCTCATTTC TTTCTATTTG ACGAA 885