EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22986 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:8013287-8014187 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr25:8013464-8013483CGACCACTAGGGAGCGGCA+6.18
Foxd3MA0041.1chr25:8013503-8013515AAACAAACATAC-6.37
Foxj3MA0851.1chr25:8013496-8013513AAAAGGTAAACAAACAT+7.74
KLF13MA0657.1chr25:8014058-8014076ACAACATGGGCGTGGCTT-6.07
POU3F1MA0786.1chr25:8014090-8014102TAATTTACATAT-6.02
POU3F2MA0787.1chr25:8014090-8014102TAATTTACATAT-6.02
SP1MA0079.4chr25:8014062-8014077CATGGGCGTGGCTTA-6.32
SP4MA0685.1chr25:8014060-8014077AACATGGGCGTGGCTTA-6.58
Enhancer Sequence
GACTGTATGA GTGTTAATGG CCAGTTTTAA GAAAGGAGAA TTAACACCTG TTAAAGAAGA 60
TTCAAGACCT ACAACACAAC ATTTCAGTAG ATTTAAGACT TTTTAAGTCC TAAAATATAC 120
GTTTTGACAT TTAAGACGTT TTAAGACTTT TAAGGAGAAT GTTGTCATAC TACTACTCGA 180
CCACTAGGGA GCGGCAATGT ACCACAAATA AAAGGTAAAC AAACATACAA AGATTTAAAG 240
TACAATTTTA CTAATTCTAA ACAACGTAAT CTTGCATATT GCTGTTCAAA CTTTTAAAAA 300
CATATTTTAT AGCAAAATAG GCCATGTAAC CAGAAATGAG AGCCGAATGT CCGCCTCCTC 360
CGGTGACAGC GCGGATCTGC TCCTCCTGCA GTCCGCTTTC TGCACGCCTC GGCTCGGCTT 420
GATCTTCTGC GTTTCCCTGC CCGAGCTGAC CATAACTGTT GGCTCCCTGT GACACCAATT 480
CAAGAGTTTA TTGTTCAGAT ATATGTAAAT GTTTCGAATT ACTAACTTTA TCAATTCAAA 540
GTTCGCGTAT TTTCGTGAAT TTCAGGTGGG GCAGTCGTGT ATAAATGTGA GTAAATGAGG 600
TGTAAATAAA CTCACCCACG TGTACAGTAG CGATACACAT TTTGACAGCT GATCTCCTTC 660
CATTAGATTT AGGCGCCAAC TGATGACATG CCTTAAAATT ATGTAAACGT CATCGGTTTT 720
CCCAGATTTA AGAAATATTA GTTGGTGGAA TGGAAATAAG CGTTGAACTA CACAACATGG 780
GCGTGGCTTA GCAGCAGATT TAATAATTTA CATATCTATT TTTTATTAAA TAAGTGACAC 840
GTTCTCAGTT TTACATTGTT AAAATATAAG CAATGTCAAC TTACAATATT ATGTATATAA 900