EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22970 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:7348462-7349735 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF4A(var.2)MA1494.1chr25:7349455-7349470AAGTCTAAAGGTCAT+6.46
KLF16MA0741.1chr25:7348891-7348902GGGGGCGTGGC-6.62
Nr2f6MA0677.1chr25:7349652-7349666AAGTTTAAAGGTCA+6
RXRBMA0855.1chr25:7349652-7349666AAGTTTAAAGGTCA+6.14
RXRGMA0856.1chr25:7349652-7349666AAGTTTAAAGGTCA+6.33
RxraMA0512.2chr25:7349652-7349666AAGTTTAAAGGTCA+6.26
SP1MA0079.4chr25:7348890-7348905TGGGGGCGTGGCTTG-7.61
SP3MA0746.2chr25:7348890-7348903TGGGGGCGTGGCT-6.34
SP4MA0685.1chr25:7348888-7348905TTTGGGGGCGTGGCTTG-7.18
SP8MA0747.1chr25:7348890-7348902TGGGGGCGTGGC-6.11
Enhancer Sequence
CTAGGGTAAT TTGGGTGGTT GCTAGGCAGT TGCTAGGGTA CCCTGGTTGG TTACTAGGCA 60
AGCCTCACAT ACATGCTTGA CAAAACGTTT ATACTTAGTA AGCATTTCTA GCAAGTTACA 120
GTACTTGGCT AGTCAATATT AGCATGTAGC TAGTCACTGC TAGCATGTGT AGCATATATG 180
AAGTTCCGTT TGCTAGCATG AGTCAAACGA GCCAATCTCC AAGTCTCTAC GATGTTCTGA 240
TGCTGAGATA TAGCTGTTGA TGAATGGTTG CTAGGGTACT CTGTTTTGTT GCTATGGGCG 300
AGGTTACAAA GTGAACTTGA ATGTGGTTGG TTGTCTTAGT CAAATGAACC AAGCCCCATG 360
TCTCTATGAC ACTGCTATGC AAAGATATGC ATCTTGGCCT ATTTTAATGG AAGTCTATGG 420
AATCAATTTG GGGGCGTGGC TTGTGAGCTT TATTATCATA TTGAGATGCT CATTGGTTGT 480
CTGAGTCAGA TGAGCCATCC CCCAAGTCAT TAGGACACTG CTATGCAAAG ATATGCATGT 540
AGGCCAGTTA TTAACATGAG TCTAGTATGA ATTAGCATGT TACTAGCATG ATTCTAGTAC 600
AAATTAGCAT GTCATTAGCA TGTTTCCAGT ATGAGTTAGC ATGTCATTAG CATGATTAGC 660
ATATGAGTAG CATGTTGCTA GCATGATTGG CATGTCATTA GCATGTTAGA ATTATAAGCA 720
TTTGATAGCA CAGCTAATTA CATTCTATAG GACAGTTGCT AGGGTGCAGT ATGTGGTAGT 780
TAGGGGTGTG GCTAGAAAGT TAAAAGGCCA TCAGTGATTG GCTGCTGGCT AGACTGAGTT 840
AAATGAGCTC AGCCATTAGT CTCTATGACA GTCTGATGCA GAGTTATGAG CTCACAAAGT 900
TTGATCCCAT GTTAAGTCAA TGAGAGTCTT TTGAATGGAA GTCTACGGGA CAGTTGCTAG 960
GGTGCCATAA GTGGTTGCTA GGGAGTGGCT AGTAAGTCTA AAGGTCATCA GTGATTGGCT 1020
GCTGACTAGA CTGAGTTGAA TGGGCCTGAC TCTAGTCTGT AGGACAGTCT GATGCAGAGT 1080
TATGAGCTCA CAAAGGTTGA CTCAATGTTA AGTCAATGGC AGTCTTTTAC AATGGAAGTC 1140
TATGGGACAG TTGCTAGGGT GCCAAAAGTG GTTGCTAGGG AGTGGCTAGT AAGTTTAAAG 1200
GTCATCAGTT ATTGGCTGCT GGCTAGACTG AGTTAAATGA GCCCAGTTAG AAGTCTGTAG 1260
GACAGTCTGA TGC 1273