EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22913 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:5835403-5836412 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr25:5835412-5835422TTTAATTAGG-6.02
HES6MA1493.1chr25:5835596-5835606AACACGTGCC-6.02
PAX1MA0779.1chr25:5835900-5835917GCCGGTGATCCGTGACG-6.39
PAX9MA0781.1chr25:5835900-5835917GCCGGTGATCCGTGACG-6.21
SOX21MA0866.1chr25:5836360-5836375AACAATTATAGTGAT+6.06
Enhancer Sequence
TGTAAAATGT TTAATTAGGT TAACTTATTT ATGATTGTCA ATATTGACTC ATATTTTAAT 60
GAGATGTCTA TCTATCCTAC CTATAGCCGG CTATATCTAC AAGAGAAACG AAATAATAAT 120
AATCCCGCGG TCTAATTATG AAACGGGGAT ATAAACGGAC TAAAAGGCAT ATCGTTAAAA 180
AAGAAAACTA TTAAACACGT GCCATGTGAC ACTTATTAAA CTGCTACAAT GTATCATTCA 240
CAATAAGAAC GACGACGTAT TCTATTGTGC GCTATTCTAT TATGACGCGT TCTATTCCAT 300
TATGACGTAT CCTACTCCGT TATGACGTGT TCTCTTTCCC GTGGCGCGTT CGGTCATGAT 360
TTCTCCGTTA TTCCTTTGTT TCAATCTACC GCAGAAAATC TCGGGCGAGA AAGCAGCGAC 420
CACGCCGGCG TTCTGGACGT AAATCACCCT CATTCTGGCC TCGGATCCGC CGTGGTGTCA 480
GTGAGCTCGG TTGCGGTGCC GGTGATCCGT GACGTGAGGC TCGGTGCGCG GGGATCGGAC 540
GGATGGATGT GCTGCGGACT CTGTGTGTCT GCTGTGGCCA TGATTCGGTG TGTTCGGCCC 600
GTCTCGTCTC TTCTCTCCTC CTTCTGTCCT GATCTGTGAT TCTTTCTCTC TCTGTCCTTC 660
GGGCTCAGAA ACACTGAATA AAGACGGAGG GGGCGGAGTC ACTGCTCTCT CTCTCTCTCT 720
CTCTCACTAA AATGTGTCTG ACTCAGATTT TTTGCTGATT TTCTGGTTCT GCTTTTTTGG 780
AAGAAGTAAA ATGGAATGAT TAATAATCAT TTTAAGATGA ATAATCCCAC AGACGCTTTA 840
TGCAGAGAAT ATAATGGCCA AGTGTGCTAC AAAATAAAGA GTTTAGCTGC AAAAACCTCT 900
TAAAGCCATT TGATATTTGC ATTTTTCTCC AACTCTTGTG TGTTGGCTCA GTAATTTAAC 960
AATTATAGTG ATGCATACAT TCTTTCTATT GCCTTTAGGG GGAAATAAT 1009