EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22912 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:5833979-5834827 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr25:5834146-5834156AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr25:5834146-5834156AGCAGCTGCT-6.02
DPRXMA1480.1chr25:5834045-5834055AGATAATCCC+6.02
HNF4A(var.2)MA1494.1chr25:5834407-5834422GTGACCTTTGAACCC-7.48
HNF4GMA0484.1chr25:5834408-5834423TGACCTTTGAACCCA-6.44
NR2C2MA0504.1chr25:5834408-5834423TGACCTTTGAACCCA-6.1
Nr2f6MA0677.1chr25:5834408-5834422TGACCTTTGAACCC-6.87
RXRBMA0855.1chr25:5834408-5834422TGACCTTTGAACCC-7.73
RXRGMA0856.1chr25:5834408-5834422TGACCTTTGAACCC-7.64
RxraMA0512.2chr25:5834408-5834422TGACCTTTGAACCC-7.64
Enhancer Sequence
TTGCAATGCA TTTAAGTAAT TATTTGTGAA ATTTACCAAC AATTTATGAA TGAAAAACTG 60
TTTCAAAGAT AATCCCAGCA TATTTTTTTT AAATGAGAGG TTGTGTAAAT GTGTTGGAAT 120
TTTCCCTTTT GGGTGAACTT TAGCATAAAG CAAAGATCAT TGCTCTTAGC AGCTGCTCCC 180
AAGTCGTGCT GTGACTGAGC TGTCGTTTAG AGGACAGTGT TAAACAACAA CCAAAGCCGC 240
GTGCCGTGGC GAATGAATCA GGGACGTTTG ATTAATGAAT CAACGAGCAC TAAAGCCCAG 300
TCTGACCTAA ATGGCCACAA AAGAACTTGC AATCTAGGTC AGAGTTCATT AGCGACCCGA 360
GGGTCAGAAC TCAAGGACTT TACCACAAAT GGCTCTCGCA CATTATTATT TATGGCGAGC 420
GGTCAGCGGT GACCTTTGAA CCCAAATGCC TACAGAAAAA GGGCAATTGG TTGAAGCATG 480
ATGCGTTTCA TTGGGGGGCC ATTAGAGCAA CTTGACATGA GATTTAAAAC ATCTGTTCTT 540
GCACAACTGA ACGCGTGCGG TGCACACGCG TGGGGTGGAA TTCCCATGAG ACAAACCGAA 600
GTGAGCCAAA CACAACAACG GATTATTATA GCCGAGCTGA CACCCTAAAC GACAAACTAC 660
TGCCGGACCA AGTGTATGTT AGCTGCACAT TCGTTTCCCA AATTATTTGA AAGTTGAAAC 720
CACTGGAACA TATCAAGGAA TCATGAAATC ACCATGGAAA AACCAAAGTA CTACAGGTCA 780
AGAATATCCC AGGGATTGAT CCTACACCCT TTTCAACGCC AATTGTATAC ATGTATATAT 840
AAAACCAA 848