EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22875 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:4454134-4455459 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr25:4454401-4454412TTAATTAATAT-6.62
POU6F1MA0628.1chr25:4454400-4454410ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr25:4454400-4454410ATTAATTAAT-6.02
ZNF143MA0088.2chr25:4454264-4454280TGCCCACAATGCATTT+6.15
Enhancer Sequence
AGTGTATAGT GTGCTATTTG GGACGCAGCT ACAGAATGTT GAAAAAAAGT ATGCTAAAGG 60
TTCCCAGATA GTTTACTGTT TCCGGTAAAA ATTCGAAGTC TAGAACCGTC CATACTCTTA 120
CCACTAATAT TGCCCACAAT GCATTTCGCT TTGGACGTGA ATTGATTAGA ACTACAAAGT 180
CTGGTAAAAT GTGTAAATAA ACTACAAACA TGGCGGACGC ACGAGACCAA CCATCAGGAG 240
GCTTCTGTAA AGTTGTTTGA ATGACTATTA ATTAATATCT AGCCATATTT ACGTTGTGTT 300
TTCCGGGTTA TATTTCATCT GCAACAATGT GAACTCAAAT TAAGATATGT TTGGACATCA 360
ATGTCTGAAT GCATAATTAT CAAAGACCTA AGGAGATTTC TCTGCACGAA AGACTCGCGA 420
ATGGCAGATT ACCCTGCTGC TGCTTCTCCA AAAAAGTAGG TAAATATGAA AGGATGTTGA 480
TTAACAGCGC TCATAAAGTT TGACAGGTAT GCTCATAAAT GCAACAATAA TCTGTTGACG 540
ATGATGTAGA ATGTCCCAAA GCTTGCATAC TCTTCTGTTA CACACTTTTC CTTCACAAAA 600
ATAGTACGTT ACATACATTT AGGGCGTAGT AGAAGTAGGC GATTTGAGAC GCAGCATTTC 660
TCATCGATTG ATTCACAAAC ACGAATCGGC TCGAACGATT CATTTGAAAG AATCGGTTCA 720
AATGAACTAA TCGTAGGTGA ATCGGACATC ACTTGTCTGA TGAACTGAAA CTCTCCCGGA 780
GAAACCGAGG GAGGAAGATG GCGGCCACTG ACCGTTCCCG GTCCGAAGCG GCGAAGCAGC 840
GGAGGCAGGA TCAGCTGCAG CGGTGGCAGG GCTCAGAGAC GGACCGGACC GGGGCGGAGG 900
CGAGGAGCCA TTCCGTCGCC CCGGGACACC GACGGGCTCG AGTGCGCTTC GCCCAGGGTG 960
CAGTGTTCAT GGCCGCCTGC TCCGCCGGGG ACCGGGAGGA GGTGGCGGAG CTCCTGCGGC 1020
AGGGAGCAGA CATCAACCAC GCCAATATAG ACGGACTCAC GGCGCTCCAT CAGGTATCCC 1080
GAACATCTCC GCTTCTTTAC GCTCAAGTTT GACTCACTTT GGAAACTTTT TGCCAGAGTT 1140
CACCAACTTT TCTCTGCGCA CTTCTCAACT GTTGAGGCGA TGATGACAAG TAGGGATGTC 1200
TACTGAGGTA AAGTTGGTTT TATATTTGCG CAGTCAGACT TTCTCCTTAA TAATTTCAGA 1260
AAAGTATTGT TTGATAAATA GTAGAATTAA ATTAGCAGCC AATGACTACC AAAGTCTAAT 1320
AAAGT 1325