EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22811 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:2438764-2439984 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr25:2439047-2439057GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr25:2439047-2439057GCTAATTAGT-6.02
LHX6MA0658.1chr25:2439047-2439057GCTAATTAGT-6.02
TFAP4MA0691.1chr25:2439549-2439559AACAGCTGAT+6.02
Enhancer Sequence
CTGGACTCCC AGCTTGGCTA GGCTGGTCAA GCTGGTTTTA GCTGGTCATC TCCCAGCCTG 60
ACCAGCTAAG ACCAGGCTGG AAATGGCTAG AAACCAGCCA GGAAGTGGCC AAAACCCCTC 120
TAAAACCAGC CTGGTCGACC AGCTAAAACC AGCCAACCAG CCAAGGCTGG TTTAAGCTGG 180
ATTTTTCAGC AGGGATATCA CCTGTTTATT AGCAATTATA AAGTAGCCCA TCTCATTTTA 240
CATCCTAATC CCACCCACAA AACCCAACCA CTACTAATAA ACAGCTAATT AGTGGTTTAT 300
TGAGCTAAAC GTCTTAGTTA ATGGTTTGTT AATAGCTTCA ATTGTACATT AAAATAAAGT 360
GTGACGGAGT TGCACGTGCG TCTCGAAATA GCACAATGCT AAGCTTTACG TCATGCTAGC 420
GTTTTGTTTT GATTACGGCC GCTACAGTTA AGGCAGAATG CTGGGAATGT GGGCTAACGC 480
TCGAGCTTTT GCACATGTGG AAACAGATGT GCTTTATATT CCAGCTCCGC TTGAGCCTTG 540
TGGACATTGT CATACTTCCG TTTGCTAGAA CAAAAAGCGC AGACGCACAC GTAACACACT 600
CGACAATCCC CTCCAGGTGT GACCGGCTAA ATGCTAACAC CTGTGGAGAC TGTCACGATG 660
GCTGGAAAAT ACACCGGAGA GCTTAACACG TCCTTTACTG GCTGCTTGAT AATTCCTGCA 720
TCCATTAAGA AGATGGAGAC ATGGAGAAGA GTAAAAGGAG CTCTACGGGA AGCGGGCGGT 780
TTGGCAACAG CTGATCTGTG ACTGGAGAGT GCATGGTAGG AGGTAGCTTA GATTCCGGAA 840
GCATTCCGGA AATGGAGGAA GAAATGTCGG ACGCAGATGA AGTGGGAAAT TCGAAAAATG 900
AATGGATTAC AGTAGAAAAA CGGAAAAGAA ACAGAAGCTG GAGTAATACA TCTGAGACTG 960
ACAGTGAGAA CGGAATGCAT CAGACAAGAC GAAGGAAAGA AGAGTTTAAG GTAGTGATGA 1020
AACTCGATTG TGGTTCATTT AGCTTTATCA ATCCGCTGAA GATGTCTAAA ACAATCAAGG 1080
AAGAGATAGG ATTGGTAGAA AGTGTTAAAA AATTGAGAGA CGGCAGGCTG TTAATATACT 1140
GTAAGGACAG CAGACAACAA AAAAAGGCTG TAGAAATTAA ATCTATCATG GGGCAAAAGG 1200
TGACTTGTAA TGTACAAGAA 1220