EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22765 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:1242849-1243806 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr25:1243317-1243327GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr25:1243317-1243327GTCACGTGAC-6.02
MITFMA0620.2chr25:1243313-1243331GCCGGTCACGTGACATTT+6.4
MITFMA0620.2chr25:1243313-1243331GCCGGTCACGTGACATTT-6.4
PAX6MA0069.1chr25:1243355-1243369TTTACGCTTGATTG+6.67
USF1MA0093.2chr25:1243316-1243327GGTCACGTGAC-6.14
USF2MA0526.2chr25:1243313-1243329GCCGGTCACGTGACAT+6.06
Enhancer Sequence
TTTGTGAACG ATATAAAACC GAATTTATCG AACTAAACTG ATAAATATTT ACACAATATC 60
TATAAGAGAC GTTATAATGC AGAGACCTGC TTACCGTTGA TTTGATCTTG ACTGAGGAAT 120
TTCGCCTGTA AGAACATAAG AAGCCAATTT AATTAGTTAG TATATTGTTT TACATGAAAA 180
TAATACATAG AAAGAGATGG CAAACTGACC ATGTTGGTGT TCAGTCCTTC TCTAAGTGCT 240
GTCAGGTGTT TGTAATGAAG CGAACTTTCA CTCCGGCAGA TGGCGCTCGA CGACAGAAAG 300
CAAAATCTCC ATCAAATCCC ATTCACTGGT CTCGAGGCGG GATTAAAACA TATAGTAAAT 360
GTGTAACGCA AGTAACAGAG TGGTATTCAA TCATTTTAAT TTTTAAATGT CTCCAGTAAC 420
AAACATTTGA CAATCACTAA ACAAGTAAGC GCTGAGGGAA AAGCGCCGGT CACGTGACAT 480
TTGCGTCAAC TGTTGTCAGA TTTGATTTTA CGCTTGATTG ACGCCGAGAA ACGAAATAAA 540
TTAAATTCTG TCCAATCGTA GCATTATTAA AATATTTAAG CATTATACTT GACCAAGTAG 600
CTGTAATAAT AAGCTAATTC TGTGTTTTGT TAGTACACAA TGATAAATAC CCTACTAAGA 660
AAAACTTAAT CAACCTATGC TGGTTGGCTG GTTTTAGCTG GTCAACCAGG CTGCTTTTAC 720
CCACTTCCAG GCTGGTTTCC AGCTATTTCC AGCCTGGTCA GGGTGGAAAA TGACCAGCGA 780
AAACCAGCTT GACCAGCCTA GCCAGGCTGG GAGTCCAGCC AAAACCAATA TGTCCAGCTT 840
TAACCAGGCT GGTCAAGCTG GTTGTAGCTG GTTTTATCTG GTCATTTTCC AGCATGACCA 900
GCTAAGACCA GGATGGAAAT GGCTGGAAAC CAGCTTGGAT GTGGCTAAAA CCCCTCT 957