EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22740 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:459686-460890 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr25:459957-459973GCCTATGTAAATAAAA+6.57
FOXB1MA0845.1chr25:459960-459971TATGTAAATAA+6.02
Foxd3MA0041.1chr25:460800-460812AAACAAACATAC-6.37
IRF4MA1419.1chr25:460138-460153GCGAAACCGAAACAA+6.8
IRF5MA1420.1chr25:460138-460152GCGAAACCGAAACA+6.12
IRF8MA0652.1chr25:460138-460152GCGAAACCGAAACA+6.7
ZNF24MA1124.1chr25:459760-459773GAATGAATGAATT-7.22
ZNF24MA1124.1chr25:459736-459749AAATGAATGAATG-7.34
ZNF24MA1124.1chr25:459740-459753GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr25:459744-459757GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr25:459748-459761GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr25:459752-459765GAATGAATGAATG-7.82
ZNF24MA1124.1chr25:459756-459769GAATGAATGAATG-7.82
Enhancer Sequence
TTCATTCCAC TGTGGTGACA CGGATTAATA AAGGAACAAG GCCAAAAAGA AAATGAATGA 60
ATGAATGAAT GAATGAATGA ATGAATTGGA CAATTAATAA ACTTTACAGC ATTCTGGCAC 120
AATATTGAAT TCAGGTTTAA TACTGACACG TGTTCAGCTT GTTCCACTCA TGAACCTTTA 180
AATATATCGT CATAAAGCGT ATATAACAGT TACTACAATC CTTCAAACGC CTGCTGCATC 240
TCTTTAATAA AGTACTTATC TAGTGAAAGT AGCCTATGTA AATAAAAGAG TTTGATATGT 300
ACCCAGTCCG GTGGTCTCCA GGTCAAAGAA CACCAGCGTC TCTTCCTCGC TTATCATGGC 360
TTTACCTGTC AAACACACAC ACACGCACAC ACACACACGT CAGAACTACA ACAGACAAAA 420
AATCTACCAC TGTGATGACT ACACACATTA TCGCGAAACC GAAACAACAG TCATTACAAA 480
GTCGACGCGA CTGAAATGTT ATTAACTAGT CGTGATTATT TTAGCGGAAG TTGTGATTGT 540
GTGAGTGTTA ATTGTGTGTG TTCTGTTGTT TAGCTCACAC ACACTGTTGT GGTTAAAGCT 600
GAGTTGTTGT AAATCCTGCA CGGACAGCAG TGTTTTCCTG CTTTTGTTGT TGTTTTTGTG 660
TTTGGAAAGT GCGAGACTCA CCGCTCGTGA TCCACTGGAG GAGCCGCAGC AGGAGTCCAG 720
TCACCGCGCG CAGAACACCC GCGATCCGCC CGAACACAGA CACACTCGCC GGGGGAACAC 780
AGGGACGCTG CGCCGCTCTC TGGAGCTTCG CCGGACACAT GACTGGAAAG TCTGCGGTGT 840
TTCGTTTTTA CAGAATACAC CCACACACAC ATCCGCTGGA AACTTTTTTG GGGTCGGTTT 900
CGAATACGAA TACACACACA GAACACACAC TCACATACAC ACTAACACAC ACACACATCT 960
CTTTTTGTAG GAAACTGCGA TATTAAATCT GTGAAGAATG AAAGTTACGC CCACATGTCA 1020
TAAGACCTAC TGTCATGACA ACACACACAC TAATAAACAC ACACTAATAA AGACACATAC 1080
ACACATTAAT AAACACAGAC AAACATACCG AGACAAACAA ACATACGCAC ACACTAATAA 1140
ACAGACACGC ATGAATTTAA GCTGTTTAAA TCAACAAGCA CCTCAAACAT GACCACTAGA 1200
GTCT 1204