EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-22727 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr25:250930-252885 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB1MA0018.3chr25:252751-252763AGTGACGTCACC+6.22
CREB1MA0018.3chr25:252751-252763AGTGACGTCACC-6.22
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr25:252751-252763AGTGACGTCACC-6.18
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr25:252751-252763AGTGACGTCACC+6.32
FOXA1MA0148.4chr25:251153-251169GACAAAGTAAACAAAT+6.39
FOXC2MA0846.1chr25:251156-251168AAAGTAAACAAA+6.62
FOXP2MA0593.1chr25:251157-251168AAGTAAACAAA+6.62
Foxa2MA0047.2chr25:251154-251166ACAAAGTAAACA-6.18
Foxj3MA0851.1chr25:251154-251171ACAAAGTAAACAAATGA+6.21
MecomMA0029.1chr25:251601-251615TGTTATCTTTTCTT-6.46
SRFMA0083.3chr25:252823-252839TGACCAAATAAGGGCT+6.4
Enhancer Sequence
AAAGCTGGGT TAATTTACCA TCTTCTAAAC CCTGAACTCT TGGTTGATTA ATCCAAAACC 60
TGCATACCAT GAGTATGTCG GTTCTAAAAC ACCTGAGAAG AGTTCGCTTA ATCAACCTCA 120
TAAAGATAAC CGCAAGTTAA TAACAGCGCA CACCGATTAC CTGAAGGCAA TATTAGTGGA 180
CCGCTGCATT CACGAGTTAC CATGGAAAGT CAAGATAAGG AAAGACAAAG TAAACAAATG 240
AGAGTAAATG TTTGAGTTTA TTAAATTACA CATGCTGTCC TCTCCTCTTT TATTAATGCA 300
TTATTGAACA CAACTTTAAC ATCCTTTTGT GTACGTTTTA TAACCATCCA AGCATTTCCT 360
TGTCCAGCTT TTAAATTTTA AAAATGTCAC ATAACCTGCT TTCTGGAATA CCCTCCAGGG 420
CATTAGGGTA GGTAAGCTAG ATATGAGGCA CAATGTGCAC ATAGCAATTC TGTGTTAGGC 480
ACATTAGTGA GGGAGTGTGT GCATTTTATA TATTTATAGT TTTCAGTGAG AGTAGTGTAC 540
TTTACAGGTG TTGCATACCT TAAAGCTGTC ATGTCTCTGT TTCTCATTAT TATTAAGTTA 600
GGAAGAGTTT GGGTTTCAAT TATAGTTAAA TGTGTTGGTT TTGCTGATTT CTTTGATTTA 660
GGTACCACTG TTGTTATCTT TTCTTCCCTT ATCATTAATA TTATTATTAT TAGTAGTAGC 720
ATTACTAATT ATTTCCATGT TGATTTTTTT TTTCTGTTAA GTTGTGTTGA GTTGAGTTAT 780
TTTTGCTTTC TTTGTAAATA AATGACTGCC TTTTAGACCA TTCTGTGCCC TTGTTTGGCT 840
GTTCTCACAC TCCAAATGTA TGGTCCTATT CCCTAGTCAC CTTAAGGTAA TTGTATGTGT 900
GGATGTGTGT TTGTGTGTGA CTAAAAACAT AACTCAATTT TTAGTAATTT TCAGATATTT 960
AGTTTTTTCC AGGTGGGTTT AGGAAAACAC TTAACGTGAT ATTGTTCACT TTATCTTTGT 1020
TTACTGTTCT TTTGACAATA GTTAGTGTTA ATAACAAGTA AAGTTTGACA GAAATTTGGG 1080
TTTCGGTTGG TGTTAAGATA TGTTAAACCA CGCTAAGCTG CTTTCTTATA ATATACTTAA 1140
AACACAGAAC GTGAAAATTT ACATCCACTG AAATAAAAGC TCATTCTGTT GGCATCAGAA 1200
AGTGTTTGTC AAGAGTATTC TGGTAATACC AGTTGAAACT GATGAAGGTA TTTTTTTGGT 1260
GACCACAAAA ATGAATACCT TAACAACACA ACACACATAC TTTTTATTCT TCCTCATGCG 1320
TCACATTAAC AGGTTTATGG TTAAACAGGG TTTACTTACT TCCAACATAT AAGCGCGAAG 1380
CCTTAGAAAT GCTGCATTTG GAGTAAATGT AATAACAACC AAGTGTGTAT TCATCCTCCA 1440
ACAGTTCTCC TGAGAAGACC AGTCGAATGT GGCCAACTAT GAAAAACAAG AACATCATGA 1500
GGAGCAGAAT AAAGTCCCAG TCTGACAGAG TAAACATAAT ATACTACCCA AAGTGCCTTT 1560
AGTATATTAG CCTTTATTAT AGTGAACTAC TTGACTTACC TTCTTCATTT TCATCACAGA 1620
CTTTACGTTT CCGATCTTTA ACAGTCATGT TCTTCAATTT CTTGTTTGAA GTCATTTTAA 1680
ATCAGTTTAT GTGAGTTTTA AAGGAGTAGG CTATGTCTCT GTCAAGTTGT TTCGTTTGCT 1740
TTCAATTCAG CTCAGTCGAA CTCAGAGTCC TCCAGAAAAT CTTTTGGCAT TCGAAGCATG 1800
GACTGACATA TACGTAGTTT CAGTGACGTC ACCCATGGGG AGGCGTGGCC AAACTTTGTT 1860
GTTTTGTTCG CGTGTCATAG CAACCACCGG CGGTGACCAA ATAAGGGCTA CTAATCATCT 1920
GGCAGATTCT GGAGTGCTTT ACAGCTCTAA AAAAC 1955