EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-21829 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr24:5883369-5884159 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr24:5884069-5884084AATTAATAATTAATA+6.17
Hmx2MA0897.1chr24:5883678-5883695ATTCTTTAATTGGTTTG-6.85
Hmx3MA0898.1chr24:5883678-5883695ATTCTTTAATTGGTTTG-6.37
POU4F1MA0790.1chr24:5884070-5884084ATTAATAATTAATA+6.15
POU4F3MA0791.1chr24:5884070-5884086ATTAATAATTAATAAT+6.2
POU4F3MA0791.1chr24:5884067-5884083TTAATTAATAATTAAT-6.37
RFX1MA0509.2chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG+7.18
RFX1MA0509.2chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG-7.18
RFX2MA0600.2chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG+7.55
RFX2MA0600.2chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG-7.56
RFX3MA0798.1chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG-7.06
RFX3MA0798.1chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG+7.46
RFX4MA0799.1chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG-6.84
RFX4MA0799.1chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG+7.62
RFX5MA0510.2chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG+7.66
RFX5MA0510.2chr24:5883510-5883526AGTTGCTATGGCAACG-7.7
Enhancer Sequence
ACTGCGTGTG ATTGACATTG AATAAATCCT TAATAGAAAT GAAATTAATA ACGCTTTAAA 60
CATATTAAAA TATTTAAATG CGTTTGCATG AATATATTGT TTTGCCATGC TCAGGTGCGA 120
GGACAGCGGG TTTTGAAGTG GAGTTGCTAT GGCAACGCGT GTTATGATTT GAGATTTGAC 180
TCGATATATG AACACGCGAA AGCTTTTGCA GGCTGTTGGT TGAGGCGAGG CGACATTTGC 240
AGAGCATTTC TGAGCGGATT CTGAGATTTC TGAAGCTGTT TGAGGATTTC TGACAGAAAA 300
CTTGTTTAAA TTCTTTAATT GGTTTGATTT TCTTGCAGGA ATTTGGATTA TTTCTTGACA 360
ATCGCTTATT TTGTTGATCT TTTTAAATTT CCACTTCGTT TTGTTCTTGT TTTTAATTTT 420
CTATCCTTTT ACTTTTTATT TTCATACCTT TTGCTGTATT TTCTTGTTTC ATTGCAGGTT 480
GGAGGTTGTC CATGGCTCTC GTGGGTGAAA GTCGAGGTAA GCCTTTAACA TTTTTCATTT 540
GTTTGTAACT GGCATTGTAT GATGTTACAA ATAAAAGATT TCTTAAAAAC GTTTGTGACA 600
TGAGTGTTAT TCATTAAAAC AATTATAATA ACAACAGGAA AAACAGAAAA AATCAATTGA 660
AAGTCAAAAA TAAAGTGAGC AGTGAGATTA AGTGTTGTTT AATTAATAAT TAATAATCAG 720
TCTGTGTGTG TTTGATGTTT GATCCTCAGG CCGCTCCAGA TCCAGGAGTG CTGCTTTCCC 780
CGAGACACAG 790