EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-21712 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr24:1112124-1113559 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GFI1MA0038.2chr24:1112219-1112231CAAATCACAGCA+6.52
GFI1MA0038.2chr24:1112365-1112377CAAATCACAGCA+6.52
Gfi1bMA0483.1chr24:1112220-1112231AAATCACAGCA+6.62
Gfi1bMA0483.1chr24:1112366-1112377AAATCACAGCA+6.62
LMX1BMA0703.2chr24:1113254-1113265TTAATTAAATT-6.32
PHOX2AMA0713.1chr24:1113255-1113266TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr24:1113255-1113266TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr24:1113255-1113266TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr24:1113255-1113266TAATTAAATTA-6.62
ZIC1MA0696.1chr24:1112224-1112238CACAGCAGGTGGTC-6.81
ZIC1MA0696.1chr24:1112370-1112384CACAGCAGGTGGTC-6.81
ZIC3MA0697.1chr24:1112223-1112238TCACAGCAGGTGGTC-6.44
ZIC3MA0697.1chr24:1112369-1112384TCACAGCAGGTGGTC-6.44
ZIC4MA0751.1chr24:1112223-1112238TCACAGCAGGTGGTC-6.49
ZIC4MA0751.1chr24:1112369-1112384TCACAGCAGGTGGTC-6.49
Enhancer Sequence
TGTTAGATAT AATCCAGAGT CTTATACACA TGAGTTTACT TACCTTAATG GAGGCAGTGC 60
TCTCAATCTC AACTCCAGCA GGGCCACATC AGCTCCAAAT CACAGCAGGT GGTCTCGATC 120
ACCTTGATTA GTTGGATCAG GTGTGTTTAA TTGTCAGGAC TAATTCAGAG TCTTGTAGAC 180
ATGAATTTGC TAACCTTCAG CCATCATCTC TAACTCAACT CCAGCAGGTT CACATCAGCT 240
CCAAATCACA GCAGGTGGTC TTGATCACCT TGATTAGCTG GATCAGGTGT GTTCAATTGT 300
CAGAATTGAC CTAGAGTCTT GTAGACATGC ATTTGCTTAC TTTAAAGCCG TGATCTCAAA 360
CTCAGCTCCT AATCACACCT GGAGGTCTTG ATCAATTTGA TTAGTGCATC AGGTGTGTTC 420
AATTTGAGCT GCAGCCCTAG AGCAATCGAG TTTGATGCCT TACAGCTGAA ACATTAGCAT 480
CAACTACATG CTTTGAAAAT AGCTATCTAT GATCTATATG CACTACTAGT GTTTTACAGG 540
CACCAATAGA CCTCAGGTGA AAGGTTTATG TGACTGTTTT CAATTTCATA CGGTTCCTTT 600
AACATTATTG ATGTTGTAAT GAGATTAAAA TATACTCTGT TAAATGAACT TCAGCATTTA 660
TTTCGTTTTT CCAAGCGTAA AACGAGATAG AAAACGTTTT AAAGCTAGCG TCATCCGGGA 720
AGGCAGGCTA GCATTGAACA TACTGTGGTA AAATTAATGT CCATATTTTA AAGACATGAC 780
GCGGTCCATT GTAAATTAAT GCAGTGCTTC TTGTATGGTC TGAGACCAAC TTTAATTCGT 840
AGCTCAATCA GACAGTGAAG ATCAGTGATT TTTAAAGATA TCAGAGCTTA AACGTGGCTT 900
TGTATAGTAT ATGACCGTTC ACCGGAAGCG CTTGAGTAAT GACTAAACTT AAAAGTCCGC 960
ATTAACTTCC TAATAAAGGG TGAAGTAAAT AAAACATTAA CTTCCTAGCT TTAAAGGTAT 1020
TTTCCCCGTT TAATGTCAGC TAGTTTTACG TGTAAAGTGA ATATTAACGT TATTAAACCT 1080
AGCCTTCATT AATGTAAAAA CGGTAGTTAT ACTTACAATT ATTTACATTA TTAATTAAAT 1140
TACCCATTAA ATTGTTTTTA TTAACGCCTA TCCCCACCAT AACCCTCACA GCAATGTAAA 1200
AATATAAATT ATTTCTGTAT AGGGTCACAA AAATGATGCT ATATTGATGC GAGCTGTATC 1260
CCTTCTAGAC TTTACCTGTA ACGTTATTTG TAATCCGCTG CTGCCCTCTG TTGGTCCATG 1320
CGCTGTCAGA ATGGCCAATG ACTTAAGATA TACAGGCCAT AAGCACTGCT TATCTTGATA 1380
TATTGATATT TACTAGATTA TATTTAATAT AGGCAATTTT TATATTTATT TTAAT 1435