EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-21625 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:44838954-44840032 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr23:44838963-44838982GAGCGCCCCCTGCTGGCCT-7.77
CTCFLMA1102.1chr23:44838964-44838978AGCGCCCCCTGCTG-6.84
FOXB1MA0845.1chr23:44839879-44839890AATGTAAATAT+6.32
Enhancer Sequence
CCACAGGTTG AGCGCCCCCT GCTGGCCTCA CTAACACCAC TTCTCCATGT GCTCTCCCAT 60
CCAGGACCAG GCTTAGTTAG CCCTGCTTGG CTTCAGCGAG TAACCACTTT TGGGCTGCAG 120
GGTGACATGG CTGTGTTGAA AATAACTGTG CAGACTGATG CAAATACAGT GTGGTTGACA 180
ATGAGCTGAG AATTTGGTAG GCTACCATGA AAATACTGTG GTTTTTGTTG ACGTAAATTA 240
GTGTCCTAAG GTGTGTTACT ATGATTTTGA TCAACATCAG TCTAGGGCGG TCATTTCTGT 300
GAGGTAAGAA CAACAAAAAA TCCCCTTTTA AAATCGTTTT TACCTTGTAT TTTACTCGAT 360
GCCACATTCA CCTTACGTTA TCTGTCTGTT AATCCATTTC TGTCTCTTTC TCTGTGCACG 420
AGCTCGGCTC CTGCGGGCGC GCGCCTACCG TGCGTGACGT CACTGCTGTG AAGAAGATGG 480
CGGCGCTCGT GAAGGCGGAA GGTAAGTGGC GGAATCTGTC GCCGTTTCCT TAACGGTTTC 540
TGTCAGCGCG CGAGCAGCCG TTTGTCGGAG CTCGTTGACA CGGTTCAGTT CTGTCCCGGT 600
GCGTGTGTGT GTTTCTATTC CTCCCGCTGT AGGGGATCGT GTTTGTGTTC GTATCCCGTT 660
TATCAGAGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTC AGTCTGTCAG TCCGGGGCCT CTGGGTTTGT 720
CATATTTACG TTTATGAATA AAATAAATGA ACACGTTTGG ATGGTTTTGG TGTGTGCGGT 780
TTTGTTGAGA GACGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTAGT GTGTGTGACT GTTATTGTTT 840
GTTCGTGTGC AGGAAACGGT GCGGTTGTGG TTTTACAATA AACTACCATG CTATTACTGT 900
TTATGTTCAC TGCTTTTACT GTTACAATGT AAATATCACG GAGAATATAA CAGTCAGCTG 960
ATGCCACAGT ACAATCGCGA AGTAAATTAT TTATCTGTGT GACATTAATA CATTACTGTA 1020
TATTGTAAAT AATGTTGACA CATGCTACAT TGATATATGA GCAAGTCCAT GCAAATGT 1078