EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-21432 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:38317698-38318596 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr23:38318122-38318134GATTGTTTTTTT+6.44
Lhx3MA0135.1chr23:38318412-38318425AAATTAATTATTC+7.34
POU4F1MA0790.1chr23:38318413-38318427AATTAATTATTCAG-6.91
POU4F2MA0683.1chr23:38318411-38318427GAAATTAATTATTCAG-6.3
POU4F3MA0791.1chr23:38318411-38318427GAAATTAATTATTCAG-6.29
ZNF384MA1125.1chr23:38317977-38317989TTTTTTTTTACA-6.07
Enhancer Sequence
TGTTGTCCTA TAAGACAACT GCAATAAGTG TAACTGACAC TGTGTCTTTT AAAGAACTTT 60
ATTGATAAAA CTGGATGCTT TTGGGGCCAG CAAACACTAT TCTTGTGAAC AGGTTGCAGG 120
GCAAAGCCCA AACAAAAGAG CAAGACAAAC AGCAGCTGGT CTCTAGCTGT TTCTCAGGCA 180
TGTCAACTAA CCGTGTTTTA GAGCATTATA ATGACGCTAC TATAGGTGGG GTCATTGACA 240
TTTATGCTAT TTTGAACAGT TTTGGTTGAC TGCAGAACTT TTTTTTTTAC ATTAATTTGT 300
TAGCTCAGGA TTAGTTTGGG ATTGCTATGT TGAGGGATTT TAAGAAGTAA ACAGTGTTGT 360
TTGTTGAAAT CAGCATGGCA GGAGCTGTAA TTAGAGCATG TCTGCAGAAT GTAAGAAAAA 420
TTCAGATTGT TTTTTTTGTT TGTTTTTTTT TTCCTTCTCT TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 480
TTTTTTACAG TGGTTATTCG GTAGATAAGT GAAGTGTTGT AGCTTCCTTT TCAACCTCCG 540
TTTCTCTTTT TTTAAAACAT CTTCGGCTTC TGTTTCTCTT TTTTCAGTGC CTAACATTAG 600
CAAAGTCTAT TTTTATGTTG TGTAGGGTCT CCCCTTCAAA GTGATTTGAA CTTGAAGTGT 660
GTGCTTGCAC TATAAGTATG TTCTAATAGT TTCTATTGAC TTTAATTCGG CAAGAAATTA 720
ATTATTCAGT TCATTCTTTT GAAGATATTT GTAACACTAT TAAATCATGT TTAGAGGTTT 780
AAGCAAAAAT AAATTGTAAA AACTTTGTAG TCTAACTGCA TTAGTACATT TTATCACCAC 840
AGAAATAGCC GTATAAACCG CCAGGTGTTA AACGCAAACA AAAAAAAAAG CCTAGTAT 898