EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-21323 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:33016346-33018525 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GSX1MA0892.1chr23:33017507-33017517CCTAATTAAA+6.02
Hmx3MA0898.1chr23:33018446-33018463AGTAATTAATTGTTTGC-6
PAX5MA0014.3chr23:33016711-33016723GAGGTCACGCTC-6.14
RFX1MA0509.2chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC+6.34
RFX1MA0509.2chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC-6.35
RFX2MA0600.2chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC+6.44
RFX2MA0600.2chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC-6.52
RFX3MA0798.1chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC+6.42
RFX3MA0798.1chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC-6.49
RFX4MA0799.1chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC-6.17
RFX4MA0799.1chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC+6.72
RFX5MA0510.2chr23:33016390-33016406TGTTGCTATGGTTACC+6.11
ZNF384MA1125.1chr23:33018308-33018320AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:33018309-33018321AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:33018310-33018322AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:33018311-33018323AAAAAAAAAAAA+6.22
Enhancer Sequence
TCTTTGTACC GGCCGGTCTT AATGGAAAGT GTTCGAGCAG CCACTGTTGC TATGGTTACC 60
CTCAGGCGAA CGCGGTTTTT GTGAGCGTTA ATTTGGTACA CCGGTGAACT TGTACCCTAA 120
CTTTTGTGGA TACTGAAATG TTTGAAAACG CCCTTGAAAC ATATAAAAGC ACACTCGCGG 180
TGCTTCCGTT AGATTATGGA TAGAATATAG ATCTCATTTT CCTTGAAACT CGATTAATTC 240
AGTCGTTTTC AGTAGCACTG CTCTGCTTTT CAGTTCATGA ATGAGCCGTT TTCTCCCTGC 300
CGACACGCCG TCTCAGGTCA AACCGCTGTT TCGCTTCAAC ACGGAGATAA AAACGATGAT 360
GTGAAGAGGT CACGCTCGAG ATGAATTCAC CTCATCTTCC TCACTGAAAG CGCCGTTTGA 420
TTGTGTTAGT CAGACCGATT AATATCTTCC CTGTCCTTCA TAGCAGATGC CGGTGATTCT 480
CATGCAAATG CTGGCCGATT TTCTACTTAA AGCAGCATTT ATTTTCTTTA GAGTCGATGT 540
CAGAGCTGTG TGAGTGGAGA AATGAAGATT TGTGAGTGCA TCTGCTGTGG TCCAGATGAA 600
CGGAGCGGAG TTTGAGGTGA GACTGAGAGA GCGAGAGCTT TGAATTATGA GCTCTCCGCA 660
ACAATCAGTT TCACATTCTG AACGTGTATC AATTTCTTTG ACAGCGTCCC ACAAAACTGA 720
ATATGTGACC GGGTTACTCG TAAATGGAAG TCAATGCCTG TTCGAAATGA CAGCGAAAAT 780
TCGGAACACG AGTATGCAGC AGATAAGATC GCTGAATGTA GAGGTATGGG GTAATAACTT 840
TAAATAATAA GCGTATACTG AATGACTAAA ACAAGGTTAA TTGATATTAA ACGCAGCAGG 900
TTCCGAAAAG TAGGCTTTAC GAACGAGAAT AAGTTAAAAC AGGATTTTCA TCTTTGATTC 960
TGATAGCATA GATGGAGCTA GTGCAAAATT GCAATCCATT CTCAAAATCA TTAGCCTATC 1020
ATTAACAACT TGGAAATTAA GTGGAATAAG TTGACATTGA GCAAAAGGTT ATTTGTTTTC 1080
AAGTAAACCC AATATTGATA CTACAGTACC AGCATCAGCA TCCCTACATA ATGCAAACGC 1140
CCCCAAATTA ATTCCCATTA TCCTAATTAA AACAGCTCGT AAACCACAAC TTCTTTGCGA 1200
TTTATGAGCA ATTGAGTCCA TATAACTAGA ATTGCTCTGA TTTTTCTCCT CATTCAATCT 1260
AACACACCGC ACAGAACACA TTAGTATTCG TGGCCACATC TCTCACGTAA AGCATCTCTG 1320
GGCTGAAATG AATTCATGAA GCACGTTTGT CCACTCACCT ACAATCCCGA AGAAAGCTGG 1380
GGATGGTCTC TAATGTTGCA CTTAAAAGAT GCCTCTGCGT TCAGCTCAGT TTTGACAGAT 1440
AGATCCACAT CCGAATGCGA ATGCCGAGTC TTCAAAGCTA GAGCAGCACC CTTCAATAAA 1500
TTTCTCACAA TTCCTCGAAG AATTCTCGCG TGCGAGACGA TGAATGAACG GACGCCGCCG 1560
CGGCTTCAGG TAACTGATCT ATGCAGCAAA AATTTACCGT CAACGCCGGA AGATGGTCAT 1620
TCACGAGCGC GCATTGCCAA GCGCACGGCA CATTCCCACA GTCCTGTGAA ACTGACAGCG 1680
GCTTGACATC ACGCCTTTTC ATCAGCAGCT CTCCGTCAGA CCGTCATGCA CGCGCTCATT 1740
GCTCGTCTGT GAAGGTTTTA CGCGAGACTG GCACAGGCAC CGGAGCCCAG CAGCGTTACA 1800
GTAGCAGCGC GTTTAAACCC AGCCCCCTGT GCTAGCACTC ACTTACGGCC GGCTCCATTT 1860
GCATGTCGCA TGCTTTAACT GTTTCATGCA CTGAACGATA ATCATTTTTC AAAATGCACA 1920
ACTGTGGCTA TAATTAGAAA TGCGCATTCG CATAAGCTTT TGAAAAAAAA AAAAAAACAT 1980
TTTAGCTGGG CAATGCGTGA CTCGCCGCGC ATCTGTATTG TGCAGACGAT ATGTGGCACT 2040
GCATGCAAAG TCTCCTATAA TGGCATTATG TGGCTTTCCA GCTGCAACTA CACTAATAGG 2100
AGTAATTAAT TGTTTGCATA AAATAGCTGT TTGCAATTAA CAGCATCTCT TTTTTTTGCA 2160
CCACATACAG TAAAGGATG 2179