EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-21268 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:30803245-30804826 
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr23:30803291-30803301AACAGCTGTT+6.02
BHLHA15(var.2)MA1472.1chr23:30803291-30803301AACAGCTGTT-6.02
HNF4GMA0484.1chr23:30803641-30803656TGACCTTTGACCTCG-6.47
KLF13MA0657.1chr23:30803523-30803541TAACAATGGGCGTGGCCT-6.75
Klf12MA0742.1chr23:30803525-30803540ACAATGGGCGTGGCC-6.59
MSCMA0665.1chr23:30803291-30803301AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr23:30803291-30803301AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr23:30803291-30803301AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr23:30803291-30803301AACAGCTGTT-6.02
NR2C2MA0504.1chr23:30803641-30803656TGACCTTTGACCTCG-8.12
NR2F2MA1111.1chr23:30803639-30803650TTTGACCTTTG-6.62
Nr2f6MA0677.1chr23:30803641-30803655TGACCTTTGACCTC-8.42
POU4F1MA0790.1chr23:30804758-30804772ATGCATAATAAATG+6.59
POU4F2MA0683.1chr23:30804758-30804774ATGCATAATAAATGTA+6.5
POU4F3MA0791.1chr23:30804758-30804774ATGCATAATAAATGTA+6.3
RXRBMA0855.1chr23:30803641-30803655TGACCTTTGACCTC-7.95
RXRGMA0856.1chr23:30803641-30803655TGACCTTTGACCTC-8.12
RxraMA0512.2chr23:30803641-30803655TGACCTTTGACCTC-8.12
SP1MA0079.4chr23:30803527-30803542AATGGGCGTGGCCTC-6.58
SP3MA0746.2chr23:30803527-30803540AATGGGCGTGGCC-6.07
SP4MA0685.1chr23:30803525-30803542ACAATGGGCGTGGCCTC-6.45
Tcf21MA0832.1chr23:30803289-30803303GAAACAGCTGTTAT-6.33
Tcf21MA0832.1chr23:30803289-30803303GAAACAGCTGTTAT+6.78
ZNF384MA1125.1chr23:30803341-30803353TTTTTTTTTTTT-6.22
Enhancer Sequence
GATTCCATAT TTAAAACATA CTATTTAATT ACGATGCTCA TCCAGAAACA GCTGTTATTT 60
TGGTTAAGAC GCACAGCTTG ACGTCTACAT ACTGTATTTT TTTTTTTTGC ATATAAGAAT 120
ATCTCTTAGC TGTCTTTTAC AACAAACAAC ATTTTGAGGT AGATTTATGT CGAAAACATG 180
CATAGTGAAA CTTCACAAAG CACAAAAAAA AGAAATATAG TTATTTTAAC GTGCGCGTCG 240
TGCTGCCTAA TATGAATCAC GTTTGATCTC GCCGCACATA ACAATGGGCG TGGCCTCGTC 300
CCGTCAGATG CGTCAGATGA GCCGCGGCTG TAGGAGCGAC TGAAGAAGAG GGGGATGGGG 360
ACAATTGTTT TTTGTGTTGC ATTCCTGCAG TGTGTTTGAC CTTTGACCTC GTTGTTGCGT 420
TCTCCTCGTC TTGCATTCCA AACTGAGGAT TTCCTGCAGT ATGCCAAAAG CTGCTGGGGC 480
TCGCCTTTTC TTCGCCCTGT GTGTGTTTAC CACTATTTAA CCAGCGGAGT CGTTCGTTAG 540
CCTAAAAATA ACACACTCAG GAACGCCGCT GCTACAACGA CCGATCGCTT TCTTAGACAA 600
GCCGTTATAC GGAAGAGCGT GCGGGGTTTA AACAGAGCGA GTACTATAGG CGAAACGCAA 660
TCAAACCCCC GTTTGGTGTT GCAGCTATTA GCCTAGCACG CTAGCGGGGC TTGCCGTATA 720
TATCACGCAC ACGTTTCATA TCCGCTGCAG AAATCCGCAC CCGCGCGACA ACACTGAGGA 780
AATGAAGGAC AAACAGAAGA GAAAGAAGGA GCGCACGTGG GCTGAGGCAG CTCGTATGGT 840
AATATATTAA TCATTTTAAG TAAATTATAA CGGTTTAGTG CTTGTGTGAG GGGTTAGGGG 900
TGTTGTAGGG GAGCCGCGAA CAAAGCTGTC TCGAGCTGTT GTCGGGTTGG ACATAAGCAA 960
TCTGCTGCTG TTTGTGTAAC TCTAGGTTTT ATAACCCGGC TTTTACCTTT GCAGTGACAC 1020
GAGTCTTAAT CCACAATCCC TGTGTTTATC CTGACGACAT AAGCGATTCA TTTCTAGTGT 1080
TTGTGTCCCA TTTGAATGAA GGAGCCCTTG CTGGTAGCCT AGCGTATTAG CAGCTCTGGC 1140
TGTTTGACCC TTTGTTTGCA GGGCTTCTTT TAGCGAGCTG AGTAAAATGC TGAAAATATT 1200
CAGTGTACAA GGTTTGGTTG TCTTAAAAGA CTGATTTTAA TAAATGTTTG TTGAATGCTT 1260
ATTGTTTAAA CAGTCATTCA TATAGTAGGC CATATTTCTA TGTTTTGTAT GCAGTTCGTG 1320
ATCCCTTGAT CTTCTTTGTT AGCTATTTAT TTATCAGTTA AACGTTTTTA GGGGGATGTT 1380
ATCTTTTTAA CGCTTTATAT CTATGTCACT GCATGTGTAT TCATACAATT GTCGATTATT 1440
AAATGGATAT GAAGCTGATG TAGTGCATAG TTTCTCCTTT ATTCTCCATA GTTGTGGTCA 1500
AAATAGGTCT GTTATGCATA ATAAATGTAA ATTAAAACAT GGTTAATATG GCTGGGAAAT 1560
TATTTCTCAT ATAACATTAA T 1581