EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-21019 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:20412207-20413081 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr23:20412581-20412591ATCACGTGAC+6.02
CDX2MA0465.1chr23:20412603-20412614TTTTATTGCTT-6.32
HOXD9MA0913.2chr23:20412602-20412612GTTTTATTGC-6.02
MITFMA0620.2chr23:20412577-20412595CATGATCACGTGACTTCG+6.3
MITFMA0620.2chr23:20412577-20412595CATGATCACGTGACTTCG-6.3
SREBF2(var.2)MA0828.1chr23:20412581-20412591ATCACGTGAC+6.02
Srebf1(var.2)MA0829.1chr23:20412581-20412591ATCACGTGAC+6.02
TFEBMA0692.1chr23:20412581-20412591ATCACGTGAC+6.02
USF2MA0526.2chr23:20412579-20412595TGATCACGTGACTTCG-6.12
Enhancer Sequence
GCTGCGCGTC CACCTGTTCA CACATGCACA ACTCACTGAA GGAGGAGTGC TCTCGCTTTT 60
CCCTCCTTCA GACAGTATTA TAAACAGGTA AGAGAGTGTG GCGACATGAT GGCTTGTAGT 120
AATCTAATGT AGTAATGTTC GAAGCTGACA AGGTTTACGC AAACTTGGCG GTAGTTCATC 180
TCCTCTCTGC GTACCACGTA CGTTGCTACT GTAGTTAATG TGTATGCTTT GTCAGATTTC 240
AAGGTTTAAG CCGAGGCTTA AGTAACAAAA TCAACTAGAA ACTGTACTAT TATTTTAAAA 300
GAAATAAAAC TACACCAGTA TCGATACTGA TCATCCATGT AGGCTATCAT CGAATATACG 360
CCAAATCGTG CATGATCACG TGACTTCGGA TATTTGTTTT ATTGCTTAAA CTCATAGTTT 420
GAAAAGTTAT GTATTTGCTC TGTGAACATT TCATAAGGAA GAAAAATAGC ACAGAAAATT 480
ATGTGGAATC AAATCTTTGC TCATAGTTTT CATCCACGAG TGACAAAATA ACTAAAGTAA 540
AAAGTATAAC TCGCTAAGTA ACTAGGTAGT TTTTTCTATA GGTGCTTACT TACTAACTCT 600
CCAGCACTAT AACACGACAC GTATTGGTTG TTTTATAATT AACCCTAAAT TGTTAGTTAT 660
TAGTGGTTAG TGAGAACAAG GGCAATAGGG TTAATAACGC ATGAACAGCC GAGGTCATCT 720
AGAGTACAAA GTTTGTGTGG GATGATACAA CTTAATGGTT TCAGGCATTA TGGTTAGGAA 780
TGACAGCTAT TTATTGTATT GTGTAGTGAC ATATTTTACC ATAGTGCTAG TATTGTAAAC 840
GTTTTGTCAG TGCTTTAATC TTTTGCAACC AAAT 874