EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-20891 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:16558193-16559341 
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXK1MA0852.2chr23:16558802-16558816AGCTTGTTTACTTT-6.17
LMX1BMA0703.2chr23:16558391-16558402AATTTAATTAA+6.32
LMX1BMA0703.2chr23:16558394-16558405TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr23:16558405-16558418TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr23:16558402-16558415AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr23:16558401-16558414AAATTAATTAATT+6.92
NFYAMA0060.3chr23:16558844-16558855TCTGATTGGCT-6.32
NFYBMA0502.1chr23:16558845-16558860CTGATTGGCTAGTGT-6.47
PHOX2AMA0713.1chr23:16558390-16558401TAATTTAATTA+6.62
POU4F1MA0790.1chr23:16558406-16558420AATTAATTATTTAT-6.63
POU4F2MA0683.1chr23:16558404-16558420TTAATTAATTATTTAT-6.65
POU4F3MA0791.1chr23:16558404-16558420TTAATTAATTATTTAT-6.78
POU6F1MA0628.1chr23:16558403-16558413ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr23:16558403-16558413ATTAATTAAT-6.02
PROP1MA0715.1chr23:16558390-16558401TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr23:16558390-16558401TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr23:16558390-16558401TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
AACAAATGTA CAGTGATTTA GAATAAATAA TTGTGTAAGG TTATTTACAA TGTGTCAGAT 60
CATATTATAT GGCGATTTAT TATAAACTGT TTGTGAAATC AGAAACAGAA AAATTTCTTC 120
GCAATGCAGT CCACAAGCCT ACTACTACTA AGTACATTGT GAGATATTAT AACTGAGTCA 180
ACAAGTCAAG AATTTGTTAA TTTAATTAAA ATTAATTAAT TATTTATTCT GTCTTCATGC 240
CATATCACTA ACTCTATTAG TATTTGGATT TGTCATGTTC CACTTCTATA CTAAAAGTAT 300
TAGTTTAAAA TTTGGGAGCA ATAAATGCAA TGCCAACATA ATTGGTCTTT GTGTTTAACG 360
TTAGAGCAGA AACAAAGTTG AACAACATCA ACCTGCTAGC TAAACCCTGG TCTTTCACTG 420
GACTATCGGC TGTGGTCGTA CTAGCTGGTC CTCTCGTGTC ATCTGCAAAT CTCCTGCAAT 480
TTAGTTATGA AACATTTGAA TGCTTCTACT ACATCTACTT TCACCCCCAC CTTTACGTTT 540
TAAACTCTGA TAAGTCGAGT CGGAGACAGT CCACGAGGAC TGCGACCCAT GCAGCTGCCA 600
CGAAAGAGAA GCTTGTTTAC TTTTCCTACG CGCATTCCGC GAAGACCTGC CTCTGATTGG 660
CTAGTGTTCG TTGCAATCGT TGGTTAGGTC AAAGAAGCTC TTTGGTTAGG TTTGCGCAAG 720
TGGAGCGACG TCACGATCGG TCGGAGCCAG TCAGCTTCAG AGCAGGGGCG GGTCTACGGG 780
TGTAAAAAAA ATACAAACTT TTAAAGAAAC GATAAATTCA GGTACCCAAC GTAACTTATG 840
CCTGCCATTA TGTTTATGTA GAAACATAAA TTCTTGCCGC CAGTGCACAT TAACCACATT 900
TTACCAACAT GATTTCACAG GTCTATTTTG TTCTAATGTT AACACATTGA CAAGATTAGA 960
AGAAATGCTT ACAGCCAGTC AGGAATAACG TTATGTAATG TTAGGCTTGG CCAGTCTAAC 1020
GTAACGTACT AACCTTACAC AACTCACGTA GTTAAGCTAA TCGCTGACAC CTTAGTTGTA 1080
ATTTAATTTA ATGTAACGTT AATTGATATA AAAACATACC AATTTAGCAT TAGCTAAACA 1140
CATTTTTC 1148