EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-20885 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:16236773-16240130 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFLMA1102.1chr23:16239547-16239561GGTGCTCCCTTGCC-6.12
ESR2MA0258.2chr23:16239216-16239231AGGGCTCTCTGACCT-6.13
NR2C2MA0504.1chr23:16238922-16238937TGCCCCTTGACCTCC-6.32
ZSCAN4MA1155.1chr23:16238321-16238336CTTGCAGTGTGTGTG-6
Znf423MA0116.1chr23:16237453-16237468GCCACCCAGGGGTCC-6.28
Znf423MA0116.1chr23:16238597-16238612GCCACCCAGGGGTCC-6.28
Znf423MA0116.1chr23:16238873-16238888GCCACCCAGGGGTCC-6.28
Znf423MA0116.1chr23:16239054-16239069GCCACCCAGGGGTCC-6.28
Znf423MA0116.1chr23:16237453-16237468GCCACCCAGGGGTCC+6.84
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Enhancer Sequence
CCCTTGCCCT CCACCTAGGA GTCTCTGACC GCAGCAAGCT GTCAAGGGGG CCACCTTTTT 60
TCATGGACTT GAAGTCTGGG CCCCAGAGGG CCCTCTTGCC CTCCACCTAG GGGTCTCTGA 120
TTTCAGCAAG CTACCCAGGG GCCCACCGTT CTTTTTGGAC TTGCAGTCTG GGACCCAGAG 180
GGCCCCCTTG CCCTCCACCT GGGAACGCTG ACCCCAGCAA GCTACCCAGG GGCCCACTTT 240
TCTCCCTAAA CTTGCAATCT GGTCCCAAGA GAGCCCTCTA ACCTCCACCT AAGGGTCTTT 300
AAAACCAGCA AGCTACCCAG GGAGAGAGGT AGACCCCCTG TGTAGCTTGC TGGCTTGAAA 360
GAGGGCCCCC TTGTCATCCA ACTAGTGGTT TCTGATACCA GCAAGGTACC CAGGGGCCCA 420
CCTCTCTCCC TGGACTTGCA GTCTGGGACC CAGAGGGCCC CCTTACACTC CACCTAGTAG 480
TCTCTGACCC CATTTAGCTA CGCTTGGGTC AACCTCTCTC CCTGGACTTG CAGTATAGGC 540
CCCAGGGTGC CCCCTTGCCC TCCACCTAGG CCTCTCTGAC CCCAGCAAGC CACCCGGGGG 600
TCCACCTCTC TCGTTGGACT TGTAATATAG GCCCCTGGGT GCCCCCTAGC ATTCCACGTA 660
GGGCTCTCAG ACCCCAGCAA GCCACCCAGG GGTCCACCTC TCTCTCTGGA CTAGCAGTGT 720
ATGCTACAGG TTGGCCCCTT GCCCTCCACT TAGGGGCTTC TGACCCTAGC AAGCTATCCA 780
GGGGTCCACC TCTCTCCCTG GACTTGCAGT ATAGGGCCCA GGATGCCCCC TTGACATACA 840
CCTAGGGCTC TCTGACCCCA ACAAGCTACC CAGGGGTCCA ACTATCTTCC TGGACAAGCA 900
GTATAGGGCC CCTGGTCCCC CCTTGCCCTT CACCCAGCGC TCTTTGACCC TAGTAAGCCA 960
CCCAGTGGTC CACCTCTTTC CCTTGACTTG CAGTAAAGCC CGCAGGGTAA CCTCTTTCCC 1020
TCCATCTAGG GCTCTCTGAC ACCAGAAAGC TACCTAGGGG TCCACCTCTT CCCTGGACTT 1080
GCAGTATAGG CCCCAAGGTG CCCCCTTGCC CTCCACCTAA GGCTCTCTGA CCCCAGCAAG 1140
CCACTCAGGG GTCCACCTCT CTCCCTGGAC TTGCAGTATA GGCCCCAGTG TGCCCCCTTG 1200
CCCTCCACCT AGGGCTCTTT GAGCCCAGCA AGCTATCCAG GGGTCCACCT CTCTCCCTGG 1260
ACTTGCAGTG TAGGCCCCAA ATTGCCCCGT GCCCTCTACG TAGGGGTCTT TGACCCCAGC 1320
AAGCTACCCT GGGGTCCACC TCTCTCCCTG GACTTGCAGT ATAGGCCCCA GGGTGTGCCG 1380
TTGCCCTCCA CCTAGGGCTT TTTGACCCTA GCAAGCCACC AAGAGGTCCA CCTCTCTCCC 1440
TGGACTTGCA GTATAGGCCC CAGGGTGCCC CCTTGCCCTC CACCTAGGGG TCTCTGACCC 1500
CAGCAAGCTA CCCTGGGGTC CACCTCTCTC CCTGGACTTG CAGTTACACT TGCAGTGTGT 1560
GTGAATGTGT GTGTGGATGT TTCCTAGAGA TGGGTTGTGG CTGTAAGACC CTTTCACCTT 1620
GGGGTCCCTG ACCCCAGCAA GCTACCCAGG GGTCCACCTC TCTCCCTGGA CTTGCAGTAT 1680
AGGCCCCAGG GGGATCCCTT GCCCTCCGTC TAGGGCCTTC TAACCCCAGC AAGATATCCA 1740
GGGGTCCACC TCTCTCCCTG GACTTGCAGT ATAGGCCCCA GGGTGCCCCC TTTCCCTCCA 1800
CCCAGGGGTC TTTGGCCCCA GCAAGCCACC CAGGGGTCCA CCTCTCTCCC TGGACTAGCA 1860
TTAAAGGGCC CAAGGTGCCC CCTTGCCCTT CACCCAGCGC TCTTTGACCC CGCACAAGCC 1920
ACCCAGGAGT CCACCTCTTT CCCTGGACTT GCAGAATAGA CCCCAGGGGG CCCATTGCCC 1980
TCCACCTAGG ATCATCTGAC CCCAGCAAGT CACCCAGGGG TCCACCTCTC TCCCTGGACT 2040
TGCTGTATAA GCCCCAAGGT GCCCCCTTGC CCTCCACCTA AGGCTCTCTG ACCCCAGCAA 2100
GCCACCCAGG GGTCCACCTC TCCCTGGACT TGCAGTATAG GGCCCAGGGT GCCCCTTGAC 2160
CTCCACCTAG GGCTCTATGA CCCCAACAAG CTACCCAGGG ATCCAAATCT CTTCCTGGAC 2220
TAGCAGTATA GGCCCCAGGA TGCCCCTTTG CCCTCCACCT AAGGGTCTCT GACCCCAGAA 2280
AGCCACCCAG GGGTCCACCT CTGTTCCTGG ACTTGCAGCA TACGCCCCAG GGTGCCCCCT 2340
TGCCCTCCAC CTAGGGGCCT GTGACCCCAG CAACCTACCC AGGAGCCCAC CTTTCTCCCT 2400
GGACTTGCAG TATAGGCCCC AATGTGCCAC TTGCCCTCCA CCTAGGGCTC TCTGACCTTA 2460
GCAAGCCACA AAGAGGACCA CCTCTCTCCC TGGACTTGCA GTATAGGCCC CAGGGTGCCC 2520
CATTGCCCAC CACCTAGGGC TCTCTGACCC CAGCAGGCTA CCCAGGGGCC TACCTCTCTC 2580
CCTTGACTTG CAGTNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN 2640
NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNNNNNNN NNNNAGCTCC 2700
ACCTAGGGGC CTAAGACCCC TGCAAGCTAC CCAGGTGTCC ACCTCTCTCC CTGGTCTTGC 2760
AATGGAGGCC CCAGGGTGCT CCCTTGCCCT CCACCTAGGG GCCTCTGACC CCAGCAAGCT 2820
ACCCAGGGGT CCACCTCTCT CCCTGGACTT GCAGTATAGG CCCCAGGGTG CCCCTTGAAT 2880
TGAATTGAAT TGAATTTTAT TTGACAGATT TTAGACAAAC TGTACAAAAA GTATTCCATA 2940
CACTTTGTTA AAAAAAACTG TCGAGGATAA AAACACAATA AAGCCCTGGG CTTATTTCCA 3000
TTGTGGTCCT CTGTTAAATA AAAACAATGT ATGGCTTCAA AATACTAATG AAGAATAAAA 3060
CAAACAGTCG CCACAGCGGT ATGAACAGCC AACCCATCCA GCACAATGTC CATCCAGCCG 3120
CCAACCTATT CACACTCAAG TAACATAATT TAAAAGATCC TCATCCACCA TGCAAAACTA 3180
ATTATCCTCA TCAAACAACC ATCTTTTAAT AGCCTTTTTG AACAACCTTA AATCTTTTAT 3240
TTCCTTGATT GCTTTTGGTA GTTTGTTCCA CATGATTGCA CTTGTATATA AAAACATATT 3300
TTTCCCCACT AAACTTCTAA ATTTAAATAA ACAAATATTA AAATCCCAAC TCCTAGT 3357