EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-20814 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:13198045-13199723 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ArxMA0874.1chr23:13198226-13198243ATGCACTAATTAATTGC+6.16
ArxMA0874.1chr23:13198227-13198244TGCACTAATTAATTGCT-6.44
DMRT3MA0610.1chr23:13198826-13198837TTTGATACATT-6.02
Hmx1MA0896.1chr23:13198230-13198247ACTAATTAATTGCTTAT-6.3
Hmx2MA0897.1chr23:13198230-13198247ACTAATTAATTGCTTAT-7.01
Hmx3MA0898.1chr23:13199089-13199106ACAATCAATTAATCGAA+6.11
Hmx3MA0898.1chr23:13198230-13198247ACTAATTAATTGCTTAT-6.88
IRF1MA0050.2chr23:13198203-13198224TTTTACTTTCTTTTTCACACT+6.57
JUNMA0488.1chr23:13199706-13199719TTGATGATGTAAT+6.28
RAXMA0718.1chr23:13198469-13198479GCCAATTAAC+6.02
ZNF384MA1125.1chr23:13198102-13198114AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr23:13198103-13198115AAAAAAAAAAAA+6.22
mix-aMA0621.1chr23:13198230-13198241ACTAATTAATT-6.62
Enhancer Sequence
CTAAGCTTTT ATTAGTTAAT CCAGGACTTT ATATCAAGGA CTTTAAACAA CAAACGGAAA 60
AAAAAAAAAA GCACTGATAG ATGGACTATC TGACAAGTTT ACACCAAAAA GTGGTTTGGT 120
ATTATTGAAA CTTTATAGCA TATCAATTTT ATGATTTTTT TTACTTTCTT TTTCACACTG 180
AATGCACTAA TTAATTGCTT ATGGAGCACG CAAAGTTGAC TAAATCCCAT TATGTGGGCA 240
CTCCTGTTGG TATTGGTCGA GGAAGAGGCT TATTAGCAAC ACCAATTCCC TTCCCGGACA 300
TTAGCCCTAG CCCTACTATG TGTGGTGTAA GCAATAATGT TGGGTTAGAA GCGAATGTAA 360
TTCATTGTCA GGATTCTAAT GTGGACCCTG TTTATGTGAA TTATACTAGT TCTGACAGTG 420
CCCAGCCAAT TAACACCTCA ACTCCAGTCT CTGCCAATGA CATGATGAGT CAGATGGGTA 480
ACATAGTACA GCTAGTAGGT CAACAGTTAG CGGATAGCAT ACTTACACAC TTGAATTTGC 540
ACAGTCAAAC AGAAGGGGCA TCAAGGCATA CTCAAACTGA TCATGGTAGT AAATACACAC 600
CTGAGCAAAA GTCCATGTTA AATGCATCAC AGATCCAAGT AGTACGGCAA AGGGAAATTA 660
GAGACCCTCC GATTTTCAGA GGCGACAAAA CGGACACTGT TACAATCGAG GAGTGGGTGG 720
AGCTCATGAA AAACTTTATA AGAAAGGGAG TTTTGCCTAT TGATGAACAG GGGGAGGAAA 780
TTTTGATACA TTTGAGGGGC AAAGCCAAAG ATGTTGTTAA AGTGGGAATG CTGTCAAGCA 840
GTTTGGATAT CAAATCAAAT CCTGATGCAG TTTACACTAT ATTACGAAAG CATTTCAGTT 900
GCCAACAGTA TTCTCCTATT CCGTTACAAG ATTTCTACAC TACACTCCCA GAACCTCAGG 960
AGGATCCCTT CGATTACTGG CTGCGTTTAA ACCGTGCTGC TGATATCACA GCTGAGTGTC 1020
TAAAACAACA AGGAAAGGTG CTAGACAATC AATTAATCGA AGTCACACGC ATGTTTATTC 1080
GGAATTGTCC AAATTCAGAG CTTGCACTGA CATTTCGCTC AAAAACCATC GACAAATGGA 1140
CAGCTCACGA AGTGCATGAG ATTCTGAATG AGTATCATTT GGAAAAAAAA CTCAGAGCTT 1200
CTGGAAAAGC ACATGGGCTT TCTCAATGTG AGAAGAAATT TTCTGTGAAT GAGATGCATG 1260
TTAGTCCTAG CTCTTGCACA GTAAAAGTTG AACAGGATTC ACTTCAGTCT AAACCATCTG 1320
AAAACATGGC TCTAGAAAAG GTGATTGATA TGCTGGAAAG AGTACTGATG AATAATAGCA 1380
ATGCACAGGC TACTAAGCAG AATTGGAAAA GAAGCAACAT GCCCAGAATT CCAGGTTTGA 1440
ATGATTCACC ATGCCTAGTG TGCAAAAACC CCTCACATTC TGCTTTTACT CACTGTAGAG 1500
ATAACAGGCT GTGCTTTCTG TGCTTCTCAT CTGGCCATGC CAGAAACAAG TGTCCAAAGG 1560
AAAGGAGAAA TTCTACCTCA GTTAATCAGC AGGCAAACTA AATGATCTAC GTGTGAGGGA 1620
GGATCACGTA GATCTTAAGA GTGAATCTCC CATAACTGAT TTTGATGATG TAATGGAT 1678