EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-20761 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:12710003-12711479 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr23:12710907-12710918TATTATGCAAT-6.02
FOXC2MA0846.1chr23:12711408-12711420TTTGTTTACATA-6.74
FOXK2MA1103.1chr23:12711408-12711419TTTGTTTACAT-6.32
FOXP2MA0593.1chr23:12711408-12711419TTTGTTTACAT-6.14
Foxd3MA0041.1chr23:12711399-12711411GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr23:12711403-12711415GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxj3MA0851.1chr23:12711405-12711422TTGTTTGTTTACATATG-6.24
LMX1BMA0703.2chr23:12710804-12710815AATTTAATTAA+6.32
PHOX2AMA0713.1chr23:12710803-12710814TAATTTAATTA+6.62
POU1F1MA0784.1chr23:12710735-12710749AATATGTAAATCAG+6.17
PROP1MA0715.1chr23:12710803-12710814TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr23:12710803-12710814TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr23:12710803-12710814TAATTTAATTA+6.62
Enhancer Sequence
AACACAGTAG TCAAGTTGAG TAGTGTAAGA GGCACTTCTT TAGCAAGGGA ATATCTGGAA 60
GCCTGATCAA CTTTCATTTG TTCTTTCTCC CGGGAGGTTC AGGTAACAAG TATGTTGCAT 120
GACTAAGTGG TGTAAATTGT CAGAAATTAT TTGACTTAAT TGCTTCCTTA TTGAATTAAA 180
GTGTGGTAGT ACAAGTTTTG TGAAGTTAAG GGGGGAGTAT GTGGCCGATT CATTTAAGAG 240
ATTTATTTAT TTACTTGTTT ATTTTTATAT GCAAGTAATA GTTAACTTCA GCAAAACTTG 300
CATCTAATGT TTTGTTTTAT TCACTTCAAG AGTTCCTATG TTTGTTGTAG GTGGGGCTGT 360
AAATAGTGTA ACACCGGGTG AATGTTAAAG CTTCCCTCTG TGTGCCCACG CTCAGTCGCG 420
TGGTGCACGC AGATGGTGAA GCAGAGGTAA TTTTCGCTCT CCTCTAATCC TACAATTATT 480
ATCCCTTTGC AGTCACAATC ATTTTATTTT GACACTAAAA TGCTGTTTAG GGTTTCTGTT 540
GTAATGTGTA TTGTTGTGAT GAGTATATTT TACTTTAAAT GGTGTGTTTA TTGTGATTTT 600
AGAGTTTTCA TTTGCACGTG TATTTTTCAT GTAGGATTGA GAGGGTTTCC AGTGTTAAAC 660
TATACTGACT GTGCCTCACT GTTTTGTTAA GGTATGTTGT TTTGGTTATT GGCTTGTTAT 720
TTTAAGGATT CAAATATGTA AATCAGTTCA AATTACAGTA ATGGTGTCAT TTAATTGTGT 780
CATGGCAGAT TTTCAACTAA TAATTTAATT AATGCAAACA AAAAGGGTTT TATTTTATCA 840
GTGATCAAAA GAAAATTAAT GCAATTTACA ATTAACAGTT ATTTAATGTT ACATATTTTA 900
TTTATATTAT GCAATTTATG TGATTTTGTT TTTATTGGCA TTTAAATGTT TAAAATAGTA 960
AAATACATAT TTCTCTGTGT GCCTGCTCAG TCGCGTGGTG CACGCAGATG GTGAAGCAGA 1020
GGATTGAGAG GGTTTCCAGT GTTAAACTAT ACTGACTGTG CCTCACTGTT TTGTTAAGGG 1080
AATAAATCAG TGTTTCTCCA CCTCATCTGT GTGTGTGACC GTGTTTGAGA GGGAAGTCCA 1140
TTTGAAGTCT GCTACATGCA CATCCGAACA ATAATTTGCA CATCGTTGAC CATAATTTAC 1200
TCGCAAACAG CGAGTAAATA TCAGGTAAAT ATTGACGACT CTGCCATAAT ACTGTTTACC 1260
TCCGGACCGG AAACTGTACC GAGGCCTTAG ACAAAGCGCG GAAGTAATGT GTGCATATAG 1320
CCCATTTCTT TCATATAGCA TGCAGCCAAC GAGGTATTTT GCTTTATATT TGTATGTTGT 1380
GTTTGAAGTT TCTAAAGTTT GTTTGTTTGT TTACATATGT TTTGATTTGT ATTAAGTACA 1440
TTTGTTTTGT ATTCATAGTT TAGTTTTCAC GGTGGA 1476