EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-20718 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:12223034-12224124 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr23:12223546-12223561AATTAAACATTAACA+6.48
SOX21MA0866.1chr23:12223265-12223280AACAATTCCAGTGTT+7.58
Sox11MA0869.1chr23:12223265-12223280AACAATTCCAGTGTT+8.25
Sox1MA0870.1chr23:12223265-12223280AACAATTCCAGTGTT+6.89
TWIST1MA1123.1chr23:12223556-12223569TAACATCTGGAAA-6.18
Enhancer Sequence
GCTGTCAACA CACACAACAC ATATTAATAT CCCATAAATG ACTTACAATT TCGGTTTTGG 60
GCACAGGATC CTTGTCTTGG CCTGAATGCA AGGGCACTGT TTTCTTGAGA GTCTTCTTAT 120
TCTGGATCAC ACATCCTCCT CTCGTATTGT TATTGCTGCA AATAAAGCCC ACATTTTAGT 180
GACAGATATT ATATAAAGTT TAAGTAAAAG CTCTATTTAA ACTTACCTGG CAACAATTCC 240
AGTGTTTTCT GCATTTTTCA TTCTAACCTT CTCCTTCCCT GACAGCTTCC TCAGTGTCGC 300
AGATGCAGTT TGTTCCTGCA GGATGGGTCC CATCGCATTA AACACTATGA AGTGTGCAAA 360
GCTCTCAGCT GTGCCCCAAA ATGTCCCATT TGTGGGCGCG TGCACGCACT GTGCGGATGA 420
GCAGCACCAT TGTAGAAATA ACAGCGTCAC TCAATATACA TTCCAGTTTT GACAAATATT 480
TGAGCTGTCC ATTAAGCAGC GTCGACCAAC TTAATTAAAC ATTAACATCT GGAAAAAGAC 540
AATAATCACC TTTGCATCTT GATTATGAAG CCATCCTCAT CTTGCAGTGA GCAAAACGCG 600
TTGAAATTGG CGTTCATGTG CATCGCTACA GCAGCTCGAC CAGACTTGTT TACCTGCTGC 660
TTTGTATGTT CGAGCATCGT TGTCGTCGTG ATGATCCTCC GATAGGCATG ATGGGAATTG 720
AAGTTTGTAT GCGAAATAAT TTAATGTAAC GACAAGCTGT GGAGATTACT CATAAAACAT 780
AGCAAAATTG GAAATGCGCA TAAATGTGAG TTTGTGTGGG TGTGTGTGGA GCTGATATGT 840
TGGATGTGTA AGTTGGCAAG ATACATTGGT TTGATAAAAT GTCCGGAAGG GTTGCCAGAT 900
CGAGGGGATA CACGCATCTG ACTGATAATA CACTTGTGAC TGTATGCAGA TTTTGTGCTT 960
GTGATCTTGA GTGACCACTT ACACATGTTC TCAACAGGAA GCTAGTGAAC ATTTCTCCAA 1020
AGCACTGAAA ACAAAAAGAA ATGTTTAGTA TTCTTAAAGG ATAGCTTTAC AATTGCACTG 1080
ATTATTTAAA 1090