EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-20607 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:6043612-6044972 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr23:6044834-6044849GGCTAATAATTAATT-6.02
KLF13MA0657.1chr23:6044775-6044793CTAAAGGGGGCGTGTCCG-6.96
KLF14MA0740.1chr23:6044778-6044792AAGGGGGCGTGTCC-7.31
KLF16MA0741.1chr23:6044780-6044791GGGGGCGTGTC-6.32
Lhx3MA0135.1chr23:6044837-6044850TAATAATTAATTA-6.18
Lhx3MA0135.1chr23:6044840-6044853TAATTAATTAGTC+6.46
RORA(var.2)MA0072.1chr23:6044612-6044626CTGACCTACATATA-6.55
RORCMA1151.1chr23:6044613-6044625TGACCTACATAT-6.37
SP8MA0747.1chr23:6044779-6044791AGGGGGCGTGTC-6.27
ZNF263MA0528.1chr23:6043836-6043857TTTCCTTTCCTCTCCTCCCTC-6.58
mix-aMA0621.1chr23:6044841-6044852AATTAATTAGT+6.62
Enhancer Sequence
GTGTCATACA AGTTGGTTCA GTCAACCTAA ACAGTACTTC TGGCTTGAAT AAACCAGGTC 60
ATTAGCTACC ACTGAATTCT CATTTTTACA GCCCAATCTC CTGAATAATG CCTGACACCG 120
TAATGCTATC TGGCACTGGC GGTTTTGATG ATTGAGTCAG TCAGAGACTC ACAGCTGGAG 180
GAGAGAAAGA CAAGAGCAGG GAAGGGGGTG GACATGTGGG GGTGTTTCCT TTCCTCTCCT 240
CCCTCTATCT CTCTCTTACT CTCTGAATGT GAGACCGGAG CTCTGCGCAG AGAGAGCCGC 300
TTCTCATTCA AACCTCCAAA GCGACCGCGG GATGTTGTAC TGTATGAAGA GTATGTGAAC 360
AAAGCGGAGA GAGAGACATA ATGAGCGGGC GGGTTCTCAA CGGGAAAATG CTGCAGCTTC 420
AGGGTCAGAG AGCAGGACGG ACAATGCACT ATCATCTCTC AAGGTAAAGC AAACCAGTGC 480
TGGACTACTT CTGAATATCA ATATCAACGC GTTATCTCTA TTGTTTCCAC CGCCGAGAGT 540
GTCAGTACTT TAAACAGCAG TCACTAACAT CACTGACCGA TTGAAATACA CTATCTCTCT 600
ATCGTGTATA CGCTTATAAG TGCTAATTGA ATTTGATTTG CAGCACAATA TGTTGGTTAA 660
TGACTCTCGC GGGAGAGCGT AATTAATTGG GGGATTAATT TCCACGCGCA TATTGTGAGT 720
GTCTTTGTGT CCGTGAGTTG TGTTAAAGTG TGCGGATAGT TGCGTGTCAC CGCCGGTGTG 780
CGAGTGTCGC AGACGGAGGC GTTGAATGTG AATGAATGGA GGTGTGTATC GGTGCATTGC 840
GGAGGGGGGA ACAGGCGGAT ATCTCGCGTC AGGAGGAACT GTTCTCTCCT ATTGTTTGAC 900
GACTGTTTGT CGATTGACCA AAGCTCGGGT TATTCACTGA AAAAGGACGC GTGGGGTGTT 960
TTTGTTTTAG TTCGTTATAT ACAGTAGGCT ACATTCCTCA CTGACCTACA TATAAGAGGA 1020
TCCGAGTGGG GTGCTGTGAG CCGGTGCTCC ACATTTTCAT TAACTGTATA GTGGCGGCGT 1080
CTCAAATCAC TGCGAGATGA CTATCTTGAA AGCATTTTAG GGTATTCTAA ACGTGTTCTA 1140
ACGTTCCTTT TTGAAGTCGA ATTCTAAAGG GGGCGTGTCC GCTGTCTTAT TAGCCTACTA 1200
GTAGAGCATC CTTTTGACAA AGGGCTAATA ATTAATTAGT CGGCTAAAGG TCAATCGTTG 1260
GGTTTGTTCC TTCATAAATC ATGTTGAAAG AGAGGATATA GGGAAAATGA TGGCTAGTGA 1320
TTGAGTTGAA TATTTCCAAA TGTGGGTTTT ACTTCTGAAA 1360