EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-20593 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:5562964-5564130 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr23:5564058-5564069TTAATTAAAAT-6.62
RUNX1MA0002.2chr23:5563306-5563317GTCTGTGGTTT+6.62
TEAD2MA1121.1chr23:5563422-5563435TCACATTCCAGCT+6.09
ZSCAN4MA1155.1chr23:5563855-5563870TTTAAAGTGTGTGCT-6.49
Enhancer Sequence
TGAAAACAGT TCTAAATTGT TTGAAAACCA TTTTAAGGTC AAATTATTAG CCCCTTTAAG 60
CAAAATATGT TCTCGATAGT CTAGAAAACA AACCATTGTT ATACAATAAC TTGCCTAATT 120
ACCCTAACCT GCCTAGATAT CCTAATTTAG TCAAGCCTGA GGGAACTGTG TACAAACAAT 180
TCAGATACGC CTTTGGAGAA ATGGGGAAAC CAGCATGTCA GAATTCACAA TCTCCTTGTA 240
ATACCTTGAT AATGCCCATG TGATTATACA CATTGGTTTT CTAATATGTC CCAAAAACAC 300
GCACGCGCGG GCACACACAC GCGGAGCCGC TGAGCGCATC TCGTCTGTGG TTTGCTGGTG 360
AAGTTGGAGC GGGTGGAGGT TTGTCCTCCT CCTCCTCGAT TGACTCCTCC TCCAGCGCTC 420
CGCTCGAGTT CGCCGTGATT TCATACCGAA GTCATACTTC ACATTCCAGC TTTACTGTCA 480
AATCAGGAGA AATATTTCTT CAAAAACATC AGCGCGGTTT GCTTTTGTAA ATGAGCTCCT 540
GCGATAAAGC CTGAAATCTC CCCTTTGCGC GCAGCAGAGC AGAGCTTTGC GTTTAAGGTA 600
AGTTGAAAAA CTCTTATTGC GCTCCTTTGT CTCATACAGG CTCTGCGCTC GCGCTGCCTG 660
CAGTTTTTAC ATCATTCTCA TTTTTGGCAT TTTTTCGGAG CTTCTACAGT GATCTTGCTT 720
TGCGCGCTCA CACACGTGAG TTCACCGACG AAAACGCATT ATTGATATTT CATACACACA 780
TGCACGAGTA TCAGCAGTCG ATGAGTATGA GAAAGTTTGT ACTACTTATT CAGCGGAGCA 840
AGCTTTTTTT ATAACCTAAC ACAGGATTAT GCCCCAAGAG TCTCCAAATA ATTTAAAGTG 900
TGTGCTTTAA ATAAAGTCAA ATATGGCTTT TTAGTTTTTA TCTAGCATAG TTTTTTTTCA 960
AGAGTTTATT TTGATTAACC TTTTTGTTTT GGTTTGTATC TCTGACGTCA CATTTTGGTG 1020
TTGTATCGAA GTTAATTGTG CTCAATTGGT TTTACTCACA TAGAAGAATA TTAAGAGTAA 1080
GTGAAACCCT TACTTTAATT AAAATAACAT TTGTGGAGGG AAAAAAATCT CTAAATATTG 1140
GTGAAACACT GTTTCATGTT CATTCG 1166