EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-20498 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr23:1124766-1126632 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr23:1124829-1124844TTTGTTTATTTTGTG-6.38
HOXA13MA0650.2chr23:1125201-1125212GTTTTATTGGG-6.62
HOXB13MA0901.2chr23:1125201-1125212GTTTTATTGGG-6.62
HOXD13MA0909.2chr23:1125201-1125212GTTTTATTGGG-6.62
IRF1MA0050.2chr23:1126215-1126236GGAAAAAAAGTGAAAGTGTTT-6.23
NEUROG1MA0623.2chr23:1125514-1125524GACATATGTC+6.02
NEUROG1MA0623.2chr23:1125514-1125524GACATATGTC-6.02
POU4F2MA0683.1chr23:1126053-1126069TTGAATATTTAATCAA+6.16
RESTMA0138.2chr23:1125263-1125284AGCTCTGTCCTAGGTGCTGTT-6.9
Enhancer Sequence
AGATGTGTGT GGATCATTTT GTGGACGCGC TTGTCGTTCA CCAGTTAGTT ATTATATGTT 60
AAATTTGTTT ATTTTGTGTG TGCGTAATTA AGACTGGCAA AATGTATATG TTATAATAAT 120
GTATTTACAC AGTTTAATAC ACTATTTATC GAAAAACAAT TAAAGGAATC ATTATGACAC 180
ATCAGATTTC ATGCATCTTA TTTATGTTTA TTATATAACA GATCATTTAT CCTGCATTTC 240
AATATTATTT ATTATTTATT TATATAATTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 300
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTCGTACAT 360
TCTTTTAACA AACGCTACCT TTAGTTCACC AATAGGAGGC AGTATAATAC ACTGATTTAA 420
CATTATATTT TATTGGTTTT ATTGGGGATT TTTCCTCTCC TTCGGGCATT AGTGTTACCT 480
GCTGTGTCCA TTCCTACAGC TCTGTCCTAG GTGCTGTTCA TTAGTGCTCA CCTTACCTCC 540
TGTCCTCCAT CCATCCATCT ATTCATCCAG GGTTTGTCAA CATACATGAT TCAATGCCAT 600
ACAACATTCC GCAAAAACCT CAAGAATCTT AATTTTCCGG CATGTTTTAC TCCTCATGTG 660
TACTGCAAGC CGTAAGTTTA TCTTCATTCT TGTTACAGTA AAGCAGATTA AAAAGTGTTT 720
TACCAGGAGT GGGGTTCGAA CCCACGCGGA CATATGTCCA TTGGATCTTA AGTCCAACGC 780
CTTAACCACT CGGCCATCCT GGTGAACATA CATTTCTTTA AAGCCAGAAG ACCTTATATG 840
TGAACAGCAA TCAGCCATGG GAATATCAAA CTATGTATGT CTAGATGTGA AATTTATGTA 900
ATCTATGCAT GCTGTTCATG CAGACTTTAC TGTCATATTT ACAACCGAGT TGCAGCTTGC 960
TAACTGACTG TTAGCATGCT AGTGGACTCG CTTACAAAAA CAACCAAAAC GTTTATATAC 1020
GTTTGATTTT TAACTAGCGT ACACGATTGA AGACTATTTA TAAATCTAGC CATTTTTATA 1080
ATGCGATATT TTAAGTCGTT TTTACAACAA TGAGGTTATA TTGTTTGACG TTTGTCTCAC 1140
AGTTAGAAAG AGCGCTAAGA AGTAAGTTAA AGCTAATGCA AACATCCAGG CTCCTTACGC 1200
AAGCGTATGT TGTAACAATA TTTCGAAAGT AAAAAGAGAA CAAGATTCCT GTGTTACATT 1260
ATGTTTTGAA ACTGCAAATA CGGTATTTTG AATATTTAAT CAAATCAGAA AAAGCTGTGA 1320
CTTAGACTGT TGGTAAATCC ATGGTAAACC CTCATAACTC AGCCCTGCCT CCACGTAAGT 1380
GCCACACACA GACGGTTTGG ATTGTTTCTG CTTTTCTGAA GTGAAAGAGG AAATAAAATC 1440
AGGTTGTTTG GAAAAAAAGT GAAAGTGTTT CAGTAGCTAC TCGTGTCTGT AATTGCTAAT 1500
ACTTGATCTA TTTGAGGAGA GAAGATGAAT TTATGTAGGG ATAGCTCACT CCAAATTTTC 1560
TGTCATCATT TACTCATCCT CCACTTTCTC TAAAGTTAAA CCTTTTGTTT CTTCTGTTGA 1620
ACAAAAAAGA AGATACACTG GTGTGTGAAA ATCCAGCTTA AACCAGCCTA GGATGGTTGG 1680
ATGGTTTTAG CTGGTCGACC AGCCTGGTTT TAGAGGGTTT TGGCCATCTC CAGCCTTTGC 1740
TGGTTAGCTT GGTAGATGAC AAGCTAAATC AGCTTGACTA GCCTAGCCAG GCTGAGAGCT 1800
TAGCCAAAAC CAGCTATGTC CAGCCTAAAG CAGGCTGGTC AAGTTGGTTT TAGCTGGTCA 1860
AATTCC 1866