EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19898 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr22:21106429-21107162 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EHFMA0598.2chr22:21106592-21106604TACTTCCGGTTT-6.02
ELF1MA0473.2chr22:21106592-21106604TACTTCCGGTTT-6.07
ELF2MA1483.1chr22:21106592-21106604TACTTCCGGTTT-6.32
ELF3MA0640.1chr22:21106591-21106604TTACTTCCGGTTT-6.11
ELF4MA0641.1chr22:21106592-21106604TACTTCCGGTTT-6.11
ELK3MA0759.1chr22:21106592-21106602TACTTCCGGT-6.02
ETV1MA0761.1chr22:21106592-21106602TACTTCCGGT-6.02
ETV2MA0762.1chr22:21106592-21106603TACTTCCGGTT-6.14
ETV4MA0764.1chr22:21106592-21106602TACTTCCGGT-6.02
IRF1MA0050.2chr22:21106872-21106893TTTCGTTTTCATTTTCTCTCT+6.16
IRF1MA0050.2chr22:21106866-21106887GTTAAGTTTCGTTTTCATTTT+7.08
IRF3MA1418.1chr22:21106869-21106890AAGTTTCGTTTTCATTTTCTC-6.98
IRF9MA0653.1chr22:21106870-21106885AGTTTCGTTTTCATT-6.41
Enhancer Sequence
CTTTTCTATT GCAAATGTTA AAGGGTCACG AAACACCAAA ACACATGTGT TGAGCTGTTG 60
ACAGTGGTAT ATGTGTCCCA CACTGCTAAA AACACTATTA GGACACCTAT ATTTCACTAA 120
AAAGTGTAAA TTGGTTGTTT TTGCGTTATT TCAAGCAAAT TCTTACTTCC GGTTTGAAAC 180
AAATTTTTGA AGCTGCGTCA CGGCCATGAC ATAATAGCCT GTATTCCAGC GTGCAGACTG 240
GACATCTGTG CCAGAGTGAG TCTTATTACG TCTTACAGTG TGCTGCATTA ATGCATGAGT 300
AAAGCTTGGT TCAAACCAAT CAGCGCGCTC TATTGTGCAA CTTCATTAAT ATTCATTACT 360
GTCAGAGTGT AGATGACAGA GACGCCACGT TGTGTTGGCA AAACAAGCGT GAAGTGTTGC 420
TTTTATAGTT TGCTGCCGTT AAGTTTCGTT TTCATTTTCT CTCTGTGAGA GCTCAGACTC 480
ACGTGTGGAT TAACAGTGTA CGCGACGCGC GACAACAATA ACTTACGTGT CTAAGGAGGA 540
TTATTGTTTA CCTGAGAGCT GTTCCAGATT CGCTTTAGTC TCCTCTTAAT AAAGACGCGG 600
CTCTAGTTGC TGGTGATTGT CCTGTCTCTA CAGATTTGGT AAGTGAGCGA CCAGTGCTCT 660
TTGTTTATTC AGTTCGTATT TTATTCGTAT CAAACAAACT ATTGCAACGA GTGTAAACAA 720
GTTAGCACTA ACA 733