EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19536 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr22:8770608-8771655 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr22:8770829-8770839GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr22:8770829-8770839GTCACGTGAC-6.02
CremMA0609.1chr22:8770802-8770812TATGACGTAA+6.02
FOXC2MA0846.1chr22:8771326-8771338ATTGTTTATTTA-6.04
FOXD2MA0847.2chr22:8771327-8771340TTGTTTATTTAAG-6.29
FOXE1MA1487.1chr22:8771326-8771341ATTGTTTATTTAAGC-7.75
Foxq1MA0040.1chr22:8771325-8771336TATTGTTTATT+6.62
HOXC13MA0907.1chr22:8771403-8771414GTTTTACGAGC-6.14
IRF1MA0050.2chr22:8771001-8771022CCCAACTTTCGGTTTCACTTG+6.25
IRF4MA1419.1chr22:8771004-8771019AACTTTCGGTTTCAC-6.13
IRF8MA0652.1chr22:8771005-8771019ACTTTCGGTTTCAC-6.51
IRF9MA0653.1chr22:8771005-8771020ACTTTCGGTTTCACT-6.16
MITFMA0620.2chr22:8770825-8770843AGAAGTCACGTGACTCTG+6.65
MITFMA0620.2chr22:8770825-8770843AGAAGTCACGTGACTCTG-6.65
Enhancer Sequence
AAATAAGTTA ACCGTTCTAA TGGCTTTAAG ATTTTTAGAG GAAGCAATAG TTCTAATGTA 60
CTGTTGAATT TCCTTTTCAA AAACAATAAA ACAAGGTATA CGCTGAGAGA ATTTACAGCG 120
GTGTATATGG AATTTAGCAA GGATTAAAAG GAGATTAACT ATTCAGCGTC TGCTGCAGAT 180
CAATCAACAG GTAGTATGAC GTAACATCCT CGTTCTCAGA AGTCACGTGA CTCTGTCGGT 240
TTAAATAGTA AGCCGTGTCA TTTCATCATT ATCATGGTTC ACTGCATCAT CCAGTCTGGA 300
TGCGTTCAAA AGAAGAAGCA ATATGACGAA CCACTCTCTC CTCCTGTGGC TGTTGTTATT 360
TCTGGACGGT GAGTCAGATT TATTTGAATA AATCCCAACT TTCGGTTTCA CTTGGTTATG 420
CGGCGGAATA ACAGTGTGCG CGGTTATTTT GCTAATTTGT TTTAGATATC CGCTGTGTTT 480
CTTAGCATCG TTGCTATTAT TGCTTTTGTT TAAGGTTGCT ACAAAGCGCC ATGTGAATAC 540
TGACAGACGA TAGTATCTAA AGATGAATCA GTCATAGCCT GTTTGCATCA TTTTTAAGGA 600
TGATGGGGTG GGCAATGGGT GTGTTTAGTA GCTAGAGGGC GCTGAAAGCC TGAATACTGC 660
TGTCAGTGTT TGACATGAAT CAATAACACT GCTTTAGTTT ATCAAAATAG AACAACATAT 720
TGTTTATTTA AGCTTTAAGT TATTGTCGTT GTCAGACAGG GTGCGACTTT CACTATTCGT 780
AAGTGTGTCT GTAACGTTTT ACGAGCGTGA ATCCTGTTTG TTGCCTCAGC ACACGCATCC 840
TGTTTGTTTC CTCATTATTG AACTGCCACT GTCAAGTTTG TTATTGTAGC CTGCCTTTGG 900
CTATAAACCA GAACAAATGT GTTTCTTGCT AAATGCACTT CAACAGTAAG CGGGGTGGAG 960
CTGATTTACT ACTGAACCGA GTTGTCATGC AACTGTCAGC TTTGAGACTC TAGGCTTTTC 1020
GGCTTTTCTT ACAATGTTTT TCAAGTC 1047