EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19523 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr22:8537434-8538870 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr22:8538010-8538021TTAATTAAAAT-6.62
Lhx3MA0135.1chr22:8537462-8537475TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr22:8537463-8537476AATTAATTAATTT-6.92
POU4F2MA0683.1chr22:8537758-8537774GTGCATAATAAATTAG+7.57
POU4F3MA0791.1chr22:8537758-8537774GTGCATAATAAATTAG+6.41
POU6F1MA0628.1chr22:8537464-8537474ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr22:8537464-8537474ATTAATTAAT-6.02
RUNX1MA0002.2chr22:8538813-8538824TTCTGTGGTTT+6.32
SOX10MA0442.2chr22:8538430-8538441AAAACAAAGCA+6.02
Enhancer Sequence
AGTGGTGTAT TGGAGAGTAC GCACCTTTTA ATTAATTAAT TTTAAATAAG TGGTTTATCC 60
TAAATAAAAT CCCAGACAGC ACACATACGT TGGGCCGACG TCGGCCGAAG GTCAACACGT 120
CGGCCCCTTT AATTCTAACA TCGGTATATG GTCGGCCAAA CATACGCATG ATCGTTCGGT 180
CGTGTGTTCT ATTGTTCCAG CTCAACAAAC GTCGGCTCTG CGTCGGTTAA CGACCAGAGG 240
CCGACGAAGC ACTTCATAAG CACTTGATCT CTCATGCCCA TGAAAGAATC CGGCAACATA 300
TTTGGTTTAC AAGTAAGTTT TTGCGTGCAT AATAAATTAG ACAAACGCGA CATGCATCAT 360
GTGAACTGCG TCGGTCGGTC CAGCTTTAAA TAGCCTACAT TAATGCAGTA AAACTGACCA 420
AAATGCCTAA AAGTATAAAA AGTTTTATTG TTAAGCTTTA ATAATGAAAA CGTTGTTTTT 480
TTCTGGTGTT AACTGCTGTT TGCTTTTTTT TATTGTGGCT TTTTCTAATA CATTTTTCCC 540
AGTGTAAAAA TCAAGTATGT TCTGCATTTC GGCTGTTTAA TTAAAATAAA CACCTTTTTA 600
CAGAGTGACA TCTTTGTTTT ATATATACTT GCATTTTTAT TTATTGGTTA TTTATTTTTG 660
ACAGTGAATG CACAAATAAA GTGTTTGTTT TGTAACAGTT TAGTAGGCTA TAAAGCTCGT 720
CTTAAAGATA ATAGCGTATA TAAAACTGCT AAATACATTT TAAATTCAAG ATTTAAAATA 780
CAAGGTTATT ATTTAAATTG TCTATGGAGT GGTCATGTTT ATAAATGTAA TACTGCATGA 840
CTTTGATGTG CGCGCGCGCG TCTCATTCCA ACTCTGGAGC GGAGAGGATG TTGCTATGGG 900
AAACGAAGCT ACAACACGAC ACGACACCAC CTAAAAGACA CAACACGACT TCTCTCAAGC 960
TGCCGTTTTG ACTGTTTTCA GGTAAGTTTA GTGCCTAAAA CAAAGCAAAT ACTACATAAA 1020
ACTGTTCCTC ACACATTTAT TATTGGCAAT TGATGAATAT TCAGTTGAAT ATTATGTTAT 1080
ATAAGAGTGG TAAGTCTTCG TAAAAGTCCG TTAGCATATT AGCACTGGTA ACGTTAGCGT 1140
CGGGGTAATA TTACGTTAAC TTACTTAATG TTAGCTCTTG TTAAACTTGT TTGTTAAAGT 1200
TTTGGCTTTT ATTTATTCTT TATGTGTAGA TGAGAGGTTT TGTCAATGTT TTATTGAATG 1260
CACTCCATAT GTAGTCTAAA ATACGCATTG TAACGTTACT GTAAAGGACC GTGAATCAAA 1320
AGTTCAATCG TGTTTTGATA TTTCATGGTA TCTTAAACTA AATGTTAAGT AAAAAAGTGT 1380
TCTGTGGTTT CAGGAGTGAG AGAATAACCT CCTGCTACAA AAAATATAAC TCAAGA 1436