EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19389 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr22:5143457-5145093 
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GBX1MA0889.1chr22:5144916-5144926GCTAATTAGT-6.02
HOXB3MA0903.1chr22:5144916-5144926GCTAATTAGT-6.02
IRF1MA0050.2chr22:5144790-5144811AAAGTGAAAGAGAAAATGATT-6.67
LHX6MA0658.1chr22:5144916-5144926GCTAATTAGT-6.02
Lhx3MA0135.1chr22:5145015-5145028TAATTAATTAATG+6.46
POU1F1MA0784.1chr22:5144911-5144925AATATGCTAATTAG+7.95
POU2F1MA0785.1chr22:5144911-5144923AATATGCTAATT+6.52
POU3F1MA0786.1chr22:5144912-5144924ATATGCTAATTA+6.44
POU3F2MA0787.1chr22:5144912-5144924ATATGCTAATTA+6.62
POU3F3MA0788.1chr22:5144911-5144924AATATGCTAATTA+7.04
POU4F1MA0790.1chr22:5145010-5145024CTACATAATTAATT+6.04
POU4F2MA0683.1chr22:5145010-5145026CTACATAATTAATTAA+6.5
POU4F3MA0791.1chr22:5145010-5145026CTACATAATTAATTAA+6.24
POU6F1MA0628.1chr22:5145017-5145027ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr22:5145017-5145027ATTAATTAAT-6.02
Enhancer Sequence
AGACAGACAG ACAGACCGAC AGACAGACCG ACGGATGGAT GGAAAGATGG ATAGATAGAT 60
ATACGGACGG ACGGACGGAC GGACGGACGG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 120
AGACAGACAG ACAGATGGAT GGATGGAAAG ATGGATAGAT AGATAGACGG ACGGACGGAC 180
GGACGGACGG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC GGATGGATGG ATGGAAAGAT 240
GGATAGATAG ATATACGGAC GGACGGACGG ACGGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 300
AGACAGACGG ATGGATGGAT GGAAAGATGG ATAGATAGAT ATACGGACGG ACGGACGGAC 360
GGACAGACAG ATAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACGGATGG ATGGAAAGAT 420
GGATAGATAG ACGGACGGAC GGACGGACGG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC 480
AGACAGACAG ATAGATAGAT AGAAAAAAGA TAGATAAAAA ATAGATAGAC AGACAGACAG 540
ACAGACAGAC GGATGAATGG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG 600
ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATTGTGTT TGTAATAAAC AACATTATAA 660
TGGCAGTAAA GCTGTTAAAA TTATCTTAAA TAAAGTCTTG TTTATACAGT ATGTGCTTTT 720
ATTTTGCCCC CTTAGTCTCT GAAAATGGCC TTGTTCATAT TTTTTCACGT TTTTCTTGTA 780
TTTTGAATTA TACATTGCAT TCTGTTGTTT TTGTTTAAAG AAACTAATTG ACCAGATTAA 840
ATAAAACTCA CAAATGGTTG TGAGTGGTTG CAAATCTGCA GTCGCTCACC AGAAACTGTA 900
ATATTGAATC TCTTGGAAAA GACCTCTTTT CCACCGATGA TCTGCAGTTC GTAAAGTCCA 960
GCGTGTTTAA ATGTGATGTC CGTGATGGTC AGAGATCCAT TCTGATGATC CAGCTTCAGT 1020
CTGTCTCTGA ATGTCTCATC AAGAACATAT AATGAGATGC TATCGATCAG TTTGTTGATT 1080
TCGGCTATAC GATCAGTTCC AAATGTCCAC AGGATCACCT CAACTTTCTT TATACTATTA 1140
AGACTACAGT GTAGAGTGAC AGAATCGCCC TCTATTACTG ATAGAACCTC CACTTCACCT 1200
GAATCAGCAA ACACAGCTGT GTTCAGAAGG AAAAAATATC ATTAGTGATT CTGCTTATAG 1260
CTCCTGCTTT TACTATTCAA GTCTTTAATC TTTACAAATA TACAAAACTT GCAAGCAAAA 1320
AAAAAAGTTG ATCAAAGTGA AAGAGAAAAT GATTTAAAAC ACTCACCTTT CAAAAGCAAA 1380
ACGTATAAAA ATAAATCGGA GAACTTCATT TTTTATGTAA GAATAAAATG TGATTTACTT 1440
CGTCAACTGT GGCAAATATG CTAATTAGTT TCTTTGTTGA TCTTAAATCG GCGCTATTTA 1500
CAAAACTCGC ATCGCTAACC CGACGTTACG ATTACGGATT AAGAAAAGGT AGGCTACATA 1560
ATTAATTAAT GTATTAGTTG TTTAAATAAT GGTTGAATTG TGTTCTTCTT CTTGAGAGCC 1620
ATTTTCTTGA TTGTTG 1636