EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19356 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr22:4122248-4123356 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr22:4122677-4122698TCTTGCTTTCGCTTTCAAAAT+6.33
IRF1MA0050.2chr22:4122830-4122851AAATGCAAAGTGAAAGCAAAT-6.75
IRF2MA0051.1chr22:4122834-4122852GCAAAGTGAAAGCAAATT+6.52
IRF2MA0051.1chr22:4122676-4122694ATCTTGCTTTCGCTTTCA-6.5
LMX1BMA0703.2chr22:4123302-4123313TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr22:4123299-4123312AAATTAATTAAAT+6.07
Enhancer Sequence
CATTACAAAA TGAAATAGTT CTGTTTGCAT TCTTATTTTT AGATACTCAC CTAAAATAAT 60
AACTCTGAAC TGCTTGGATA AGACGTCATT TCCGCCGACA GTATTTAATT CGTAGAGTCC 120
AGCGTGTTGG GATGTTGCGT TTGCGATGGT CAGAGATCCA GTTTGAGCAT CCAAACTCAG 180
TTTGCCTCTG AATTTCCCGT TCAGTACTTC ATTATATACT GATATCTTGT TGATGGCGTT 240
GTTGATTTGA GCTATTCGGG TGCTGTCAGG TCCAAACGTC CATAGAACAC GCTCATATTT 300
CTGAACATTT GTAAGAGCAG ATTGTAGCGT GACAGAATCT CCGTCATGCA CCAATTTGAT 360
ATTACCAAAC GCACCTGGAT AACAAAGAGA AGTTTATAAG ATGCGAAATA AATAAACATT 420
AAAGTGCTAT CTTGCTTTCG CTTTCAAAAT ATATGAAAAC CTCTTATATT GTAACGTTAG 480
CCGTTTAGCT AGCTCAGAAG GCGAATCATT TGTGGGTAAA CTACCAAGCT CACGATGTGT 540
ATGTAATATA ATAATATAAA TAATTTGAAA ACATACAATT CCAAATGCAA AGTGAAAGCA 600
AATTACCTTT CAGCAAGAAG CACATACATA AACAAAATAG CGTCATTTTG ATGTAGTTAG 660
ATGTAAACTT AGCAAACTTT CTTGTCTTCA TTGGCGGTCC ATTCAAACCC GCGACACACC 720
TTAACTAATA ACACTATATT TAACCAAAAC ATCAATAGAC TTTATAGCGG TAACCATTTG 780
TGATGTATAT TCTCCTTTAT ATTCTCATGA TAAGCAAGTC CAGTATTTCG AGTCCAATAT 840
ATTAAGTTTC GAGTAAAAGT AGATAAGATA GCCGAGTGTC AACACTCTTC CTGTTTGATC 900
AGGTGATCTC CGCCTATATC AATGGGAAAG TTTTGGGAAT ATGACGCTGT GAAATATGGA 960
TTAATCAAAT GGTAATGAAA TTAATGATTT TAGCCTAGCT GTTAATGTAT TTTAGGCTAC 1020
TCTCTAGTTA TGTGAGGATA TTTTATAAAT TAAATTAATT AAATTGCGTA TAGGCGATTG 1080
TCACATGTTT GAAGGTAAAA AAAAGTTT 1108