EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR001-19242 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_2.5hpf 
Coordinate
chr22:2020881-2022037 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr22:2021355-2021365TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr22:2021355-2021365TTTAATTAGA-6.02
BATF3MA0835.1chr22:2021426-2021440TGATGACGTCAGCG-6.56
BATF3MA0835.1chr22:2021426-2021440TGATGACGTCAGCG+7.03
Nkx3-2MA0122.3chr22:2021262-2021275TTAACCACTTAAT+6.98
Enhancer Sequence
GAGAAGCTGC AGGTTTGATT TTGTATATTT GTTATTAGTT TTTTGTGTGC CTGTTCAGGA 60
TTGAGAAGAT TTTCACTTTC AGTGATACAT ACTAGTGGTA TGGTAGGGTT CGGTTTGGTA 120
AGCTCTTATG GCTGTTTCCA CTGTCAAAAA GCAGACTAAA CCGTACCGTA CCACTTTTCC 180
GGCAGAATAA AATTTTACGT GGAGAATAAT TTTATGTAAG AGACCAACAT ATTAAAGCCT 240
CCTTATAAAA ACTAGATACT TTTAAGGGAA TTTTAGAGAT GTCAAAATTA CAGTGCAACA 300
AAAAATGTAA ACCTCCAACT GAGGTAAAAA TATAATTTGG AATAAAATTC CAACATGACG 360
TTCGGTTGTT TAAAATCGTC GTTAACCACT TAATTTTAAA TAAATTATTA AGTGTGGGGA 420
AAACCCACTA AATCAAATCC TCCCATGGCC CGATCAGCTA GCGTAAGGCT TTTTTTTAAT 480
TAGATGAGTT TTACATTTCT AAACAAAGTA GGTTTTGTTG ATCCTCTGTT GCTACCGCCT 540
CGCAGTGATG ACGTCAGCGN NNNNNNNNNC TGACGCGTTC ATTCAGCGTC GAGTCTTCAG 600
AGCTGAGGTA AGTCGTTGAC GCTTTTTCTC GTGTTTACAC AACAATAAAA CACACTTTAC 660
AGTTTATTAA AGCGACAATC TGCGACTAGT TTCTGCATTG AGTTCACCTC TATCTGTGTG 720
TCTGCTGACC AAAACAATAC AGCAGGCAGA GAGGAGCTCT GAGAATAACA TATGAGCTCA 780
GTGTTTGGGT TTATCTGTGC GTCTTTCCAC GTGTCTGTTT TACTAATATT CCAAAGTATG 840
ATTTGTCCTG AATAATAAGA ATCTACTCCG CCAGGTATAT ACGTAGAAAG TTTATATTTA 900
CGTAGAAAAT CTTAAATTAG TTTGTGGAGC TCTTTCTTTT CTACAGGTTT TGTGGTTCTC 960
CAGTTTCTAC ATAGATGTGC AGCTGCTAAT CTAATGACTA ATTTGTTATG AATACTTGTT 1020
TTGTGTGATG TTGTTATAAA TGTAAAATAT ATGTTTTATT AATTACGACA GTGATGAGTT 1080
CATACTGCAA AAACTTTAAT GAGTGTTTAT AGTCTGAGGC TCAATTATAT TATCAGACCT 1140
GCTGAAATCC CCTTTA 1156